Mishima-syk/py4chemoinformatics

環境設定周りについて

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こちらの資料でケモインフォを勉強させていただいています。
大変わかりやすい資料をありがとうございます。
当方、Macを利用しているのですが、環境周りで2点そのままでは動かない部分があったのでご報告です。

  1. 仮想環境でのjupyter notebook起動について
    こちらについて、仮想環境側でもjupyter notebookをインストールする必要がありました。
    (py4chemoinformatics) $ conda install notebook ipykernel

  2. 仮想環境
    こちらで仮想環境から出る際のコマンドとしてsource deactivateとありますが、conda deactivateとする必要がありました。
    https://stackoverflow.com/questions/53454777/conda-source-deactivate-bash-deactivate-no-such-file-or-directory

kzfm commented

報告ありがとうございます。

  1. 仮想環境側にanacondaをインストールしてもjupyterが一緒にインストールされなかったということでしょうか?
kzfm commented

2はdeprecationwarning出てますね。修正しておきます、ありがとうございました

DeprecationWarning: 'source deactivate' is deprecated. Use 'conda deactivate'.

1についてですが、こちらに沿ってAnacondaインストール→仮想環境構築という形で進めました。
仮想環境ではない、base環境では(base)$ jupyter notebookとして問題なく起動できていました。

kzfm commented

了解です、注釈付けておきます。

@kzfm

$ source activate 仮想環境の名前 # 仮想環境を使う(mac/linux)

こちらも

conda activate 仮想環境の名前

の方が良いかもですね。