マスクメロン版 Ghostscript のサポート解除
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標準で日本語設定がなされているという理由で，Ver. 1.9.9 から採用された「マスクメロン版 Ghostscript のサポート」（パスの自動判定のサーチ対象に含め，かつ優先順位を最高に）ですが，これは X11 依存性があることが判明。
X11が標準でインストールされていない 10.8 Mountain Lion 以降で実行すると，次のようなダイアログが出てエラーとなってしまいます。
10.8 以降では，X11依存性のあるアプリは XQuartz を別途インストールせねばなりません。ですが XQuartz は一度インストールすると完全なアンインストールが難しい（OS再インストール or OSアップデートするしかない）ので，インストールを勧めるのは気が進みません。個人的にも，一度インストールしてしまうとX11依存・非依存の判定が難しくなることもあり，極力インストールしたくないところです。
「10.8 以降で標準で動かない」という理由で，マスクメロン版 Ghostscript.app はサポート対象から外すのがよいのではないかと思います。
解除しておきました。
一方で，10.6 では標準でX11がインストールされているので，v.1.10.x 系列では引き続きマスクメロン版サポートを続けてよいと思います。
了解しました。設定が完了していない環境については Ghostscript/OS X - TeX Wiki を参考にやってもらうしかないですね。
小川版 UpTeX.app が BasicTeX + texlive-collection-langjapanese ベースになって復活したので、Windows で dmg を解凍して README.pdf やら本体やらを見ているところです。TeX Live バイナリへのシンボリックリンクたちが /Applications/UpTeX.app/Contents/Resources/texbin/ に入るようになっているので、こちらには対応してもいいかも？（Yosemite / El Capitan に対応しているそうですが、実機がないので試せないので）
/Applications/UpTeX.app/Contents/Resources/texbin/ に入るようになっているので、こちらには対応してもいいかも？
Ver. 2.0.x, Ver.1.10.x の両系列で対応しておきました。
ありがとうございます。El Capitan のフォント周りは UpTeX.app に先を越されてしまいました（texmf-local/fonts 以下にヒラギノ ttc たちへのシンボリックリンクと北川さんの jfontmaps が取り込まれている）が、ぼちぼち Golden Master 版も固まってきたようなので TeX Live 側の対応を始めてもらうことになりますね。TeX Wiki もこの方法を書くべき時期に入ってきたと思います。
まだ UpTeX.app を見ていないのですが，UpTeX.app のシンボリックリンクの張り方はmunepiさんの案に沿う感じでしょうか？
シンボリックリンクの張り方はディストリビューション間で統一されていた方がよいですね。
そうなっているように見えます（Windows で HFSExplorer からモニターできる範囲で）。ヒラギノと游について Yosemite 付属 otf へのシンボリックリンクの姿があり、ヒラギノに限って新しい El Capitan 付属 ttc のシンボリックリンクが用意されているようです。これらの貼り方は北川さんの jfontmaps からも一意に決まると思うので、これは TeX Live 本体でも同様になると思います。
ありがとうございます。
では，今後のロードマップとしては，
- TeX Live に北川さんの hiragino-elcapitan[-pron] を取り込んでもらう
- TeX Live 2015 ユーザには，TeX Live のレポジトリ更新 ＋ lnsysfnt.shの実行 ＋ updmap 変更をしてもらうよう告知する
- sudo tlmgr update --self --all
- sudo ./lnsysfnt.sh
- sudo mktexlsr
- sudo kanji-config-updmap-sys hiragino-elcapitan-pron
- 美文書第6版ユーザには，手動でこれと同じことを実現する方法を提示する（？）
という感じでしょうか。
おそらくそれが一番良いと思います。実機がある doraTeX さんに lnsysfnt.sh と新しい jfontmaps の TeX Live での動作確認および UpTeX.app の挙動確認はお願いしたいと思いますが、それで問題なければロードマップどおりに進めていきましょう。
美文書第6版ユーザには，手動でこれと同じことを実現する方法を提示する（？）
できればサポートページに「lnsysfnt.sh 実行 → jfontmaps の新しいものを texmf-local に入れる → mktexlsr → kanji-config-updmap-sys 実行」をまとめた AppleScript でも置いておいて、自動でやると楽でしょうね。
小川版 UpTeX.app が10月9日の変更でシンボリックリンク作成先を
UpTeX.app/Contents/Resources/texbin/ から UpTeX.app/Contents/Resources/TEX/texbin/ へ
変更したようです（TEX は大文字らしい）。こちらも追加しなければならないでしょうね。
対応しておきました。次回アップデート時に反映されます。
ありがとうございます。