使用deeptools计算ChIP-seq样本之间的相关性 | Dean's blog

[thereallda]

https://thereallda.github.io/2022/01/24/%E4%BD%BF%E7%94%A8deeptools%E8%AE%A1%E7%AE%97ChIP-seq%E6%A0%B7%E6%9C%AC%E4%B9%8B%E9%97%B4%E7%9A%84%E7%9B%B8%E5%85%B3%E6%80%A7/

整理ChIP-seq / CUT & Tag 分析时用到的工具。本文只对使用的工具用法进行简单介绍。 当我们需要评估ChIP-seq类测序数据的相关性时，deeptools 是一个可行且方便的工具。它提供了一系列方便的命令对高通量测序数据进行分析。本文先集中介绍deeptools中计算ChIP-seq样本间相关性所用到的命令，其余的命令有机会再一一介绍。