使用deeptools生成ChIP-seq信号热图与谱图 | Dean's blog

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https://thereallda.github.io/2022/01/24/%E4%BD%BF%E7%94%A8deeptools%E7%94%9F%E6%88%90ChIP-seq%E4%BF%A1%E5%8F%B7%E7%83%AD%E5%9B%BE%E4%B8%8E%E8%B0%B1%E5%9B%BE/

整理ChIP-seq / CUT & Tag 分析时用到的工具。本文只对使用的工具用法进行简单介绍。 deeptools 提供了computeMatrix命令以计算特定基因组区域的ChIP-seq信号，并通过plotHeatmap和plotProfile函数分别产生ChIP-seq信号热图与谱图。