geneformer-cell-class | Dean's blog

[thereallda]

https://thereallda.github.io/2023/08/02/geneformer-cell-class/#more

Geneformer for cell type annotationGeneformer 是一个基于30M scRNA-seq data训练的Transformer模型，该训练数据包括多种人类的组织器官。Geneformer可以用于细胞水平的分类预测和基因水平的分类预测（例如预测是否为耐药基因），这里我们先根据教程演示其在细胞类型预测上的步骤。