Change scenario directory structure

[wateret]

As is:

sce
└── {example}
    ├── config.lua
    ├── stage
    │   ├── {01}.lua
    │   └── {02}.lua

To be:

sce
└── {example}
    ├── script
    │   ├── config.lua
    │   ├── {01}.lua
    │   └── {02}.lua