概要

POSCARを入力とし、以下の手順を自動化するスクリプト群。qsubするスクリプト内で以下の計算を全て記述しないといけないため、「スクリプトを書くスクリプト」でスクリプトを書いたあとに、連結する構成にしている。分割したのは、デバッグのため。

使い方

all_convergence.shに引数として、POSCARのパスを入れる。e.g) sh all_convergence.sh poscar_file/normal_Si

all_convergence.sh: 計算を回すためのファイル
create_INCAR.sh : K点収束計算のためのINCARファイルを生成するスクリプト
create_POTCAR.sh: all_convergence.shの引数として入れたPOSCARファイルから、POTCARファイルを構成するためのスクリプト
create_POSCAR.sh: all_convergence.shの引数として入れたPOSCARファイルを、ファイル名をPOSCARに変更するためのスクリプト
create_conv_cpp.sh : 収束判定を行うためのC++ファイルを生成するためのスクリプト
generate_kpoints.py : all_convergence.shの引数として入れたPOSCARファイルから、結晶ベクトルの比をもとにK点収束用のK点リストを生成するpythonファイル
create_run_vasp_KP-conv.sh : K点収束計算を行うスクリプトを生成するスクリプト
create_run_vasp_ENCUT-conv.sh : INCARにおけるENCUTの収束計算を行うスクリプトを生成するスクリプト
create_run_vasp_relax.sh : 緩和計算を行うスクリプトを生成するスクリプト
create_run_vasp_bandgap_cal.sh : バンドギャップ計算のためのDFTを行うスクリプトを生成するスクリプト
calculate_bandgap.sh : バンドギャップ計算を行ったDOSCARから、バンドギャップを計算するC＋＋ファイルを生成し、バンドギャップ計算を行うスクリプト

bandgap_result.csv : bandgapの計算結果が入ったファイル。なお、nonmetal列が1ならば、bandgapはゼロである。（入力された値はDOSCARにおけるステップ幅なので、無意味）。例として入っているfcc_Siは導体なので、nonmetal列が1になっている。
workspace__*/kptest.dat : K点収束計算の結果
workspace__*/encut_test.dat : INCARにおけるENCUTの収束計算の結果
workspace__*/final_DOSCAR : 緩和計算後の最終的なバンドギャップ計算を行った後のDOSCARファイル。bandgap_result.csvは、このファイルをもとに計算する
workspace__*/final_OUTCAR : 緩和計算後の最終的なバンドギャップ計算を行った後のOUTCARファイル。
workspace__*/used_POTCAR.txt : どのPOTCARファイルを使ったかを記録するためのファイル。