Cytoscape Synchronous Boolean Networks Plugin

Плагин для системы Cytoscape, который добавляет возможности для взаимодейтсвия с синхронными булевыми сетями: построение и анализ.

Основные возможности:

  • Задание булевых функций, описывающих сеть, различными способами:
    • Вручную, путем редактирования таблиц истинности
    • Строкой, с использованием библиотеки MXParser (Доступные операции)

Основная панель для задания функций

  • Автоматическое построение синхронной сети
  • Поиск неподвижных точек и аттракторов

Синхронная сеть и ее аттракторы

  • Вставка мотивов (небольших связных графов)
  • Поддержка формата .cnet (.net)

cytoscape-boolean-network.jar