/sdd1_coral_growth

Base d'un projet portant sur la croissance des coraux

Croissance des coraux

Module 5

Etat d'avancement

Réalisez la suite d'opérations demandée sur le jeu de données coral_growth

  • Créez votre projet à partir du dépôt GitHub Classroom fournit

  • Organisez votre projet en un ensemble de sections. La théorie liée à l'organisation d'un projet se situe dans l'annexe dédié aux projets dans RStudio

  • Dans un script R, importez vos données depuis l'url suivant :

https://docs.google.com/spreadsheets/d/e/2PACX-1vSxqegwJVjO0PxIs7mObr0syeYwNdpvd25AWUoWkwocQexYUqQUK0hC57NwsypQQUDnsJLiR-hxzSFA/pub?output=csv

La théorie liée à l'importation des données depuis un url se situe dans la section relative à l'imporation des données depuis Internet

  • Enregistrez un copie en local de ce jeu de données.

  • Dans un fichier au format Rmd, importez les données à partir de la copie enregistrée précédement.

Ce jeu de données comprend 8 variables :

Ce jeu de données reprend des mesures de croissance de différentes espèces de coraux. La masse est mesurée en t0 puis une seconde fois après 7 jours de suivi.

  • localisation : aquarium dans lequel la bouture est placée. Les installations sont composées de deux unités (A et B)et de plusieurs bacs par unité.
  • species : espèce étudiée
  • id : code de l'individu
  • salinity : salinité mesurée en t7
  • temperature : température mesurée en t7
  • date : date de la mesure en t7
  • time : nombre de jour entre la mesure initiale et finale
  • gain : gain de masse en g entre le jour t0 et t7
  • gain_std : gain/masse initiale

Remaniement des données

  • Transformez la variable localisation et la variable species en variable facteur.

  • Dans votre fichier Rmd, réalisez un tableau réduit en retirant du tableau principal la variable salinity, temperature et date. Affichez votre nouveau tableau dans votre rapport.

  • Dans votre fichier Rmd, réalisez un tableau réduit qui utilise le tableau réalisé ci-dessus qui filtre les valeurs négatives dans la variable gain. Affichez votre nouveau tableau dans votre rapport.

  • Dans votre fichier Rmd, Calculez de nouvelles variables que vous ajoutez au tableau de base.

    • Divisez le gain de masse par le nombre de jour d'expérience.
    • Divisez le gain de masse standardisé par le nombre de jour d'expérience et multipliez cette nouvelle variable par 100 pour obtenir la croissance en pourcent par jour.

  • Réalisez au minimum 2 tableaux résumant les données par aquarium et par espèce. Ce tableau doit contenir le nombre d'observation, la valeur minimale, la valeur maximale, la valeur médiane et la moyenne.

note: Chaque tableau doit être commenté dans le texte de votre fichier Rmd.