Les données employées dans le cadre de cette étude proviennent des recherches du professeur Philippe Grosjean portant sur la croissance de Paracentrotus lividus Lamarck (1816).
Vous trouverez des informations importantes depuis R comme ceci :
?urchin_bio
Il est possible que ce document évolue au cours du temps. N'hésitez pas à aller vérifier le lien suivant afin de voir les modifications dans les consignes : https://github.com/BioDataScience-Course/sdd1_urchin_bio
Vous pouvez vous inspirer d'un exemple d'analyse sur le jeu de données iris, voir sdd1_iris.
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Ouvrez /R/urchin_bio.R
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Etudiez le contenu du fichier, et voyez l'aide en ligne
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Représentez la hauteur en fonction de la masse des oursins
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Représentez les parties solides en fonction de la masse immergées des oursins
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Explorez par vous-même le jeu de données urchin qui contient pas moins de 19 variables que vous pouvez représenter graphiquement. Réalisez au moins 5 graphiques différents.
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Un embryon de rapport se trouve dans le sous-dossier
analysis -
Insérez vos graphiques les plus pertinents (issu de votre travail dan la partie 1) dans la section résultat de votre rapport d'analyse.
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Débutez la rédaction de votre rapport en apportant une attention toute particulière à la structure et au style scientifique (inspirez-vous du rapport sur
iris).
Bonus :
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Ajoutez une ou deux images dans votre introduction de rapport (vous trouverez ces images dans le sous-dossier
figures). -
Citez la référence bibliographique qui se trouve dans le sous-dossier
bibliography.
A la fin de ce module, vous devez avoir décidé d'un but dans votre recherche. Il s'agit donc de se poser une question sur les données mise à votre disposition. Ajoutez au moins 3 graphiques pertinents en lien avec la question que vous vous posez. Chaque graphiques doit évidement être commenté dans le texte.
note Il n'est pas nécessaire de garder les 5 graphiques demandé lors du module 2. Vous devez gardez les graphiques les plus pertinents.
A la fin de ce module, vous devez avoir intégré au moins un tableau qui résume vos données. Ce tableau doit être pertinent et en lien avec votre question de recherhce fixé lors des deux modules précédents.
Votre rapport écrit doit contenir les sections suivantes :
- une section introduction sur les organismes que vous étudiez
- une section but qui présente la question que vous vous posez sur ces données
- une section m&m courte qui présente l'acquisition des données
- une section résultats qui présente vos différents tableaux et graphiques
- une section discussion vide
- une section conclusion vide
A la fin de ce module, vous devez avoir progressé dans l'écriture de votre rapport. Si la réalisation d'un test de chi^2 se prête à la question de recherche que vous vous êtes posé, intégrez cette analyse statistique dans vos résultats