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A matlab app for whole-body fluoscent images processing

Simple Fluo Processing

A matlab app for whole-body fluoscent images processing

安装

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  • 在目录中找到的刚刚下载的mlappinstall文件,双击即可自动开始安装

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  • 安装成功后,在APP栏中会出现标题为Whole-body imaging processing plugin的图标 image-20201205120703269

使用

  • 单击APP栏中的插件图标,即可开始使用

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目前已实现功能

  1. 图片的导入导出(支持tif, png, jpg, bmp四种格式)

    • 建议导入tif格式图片,处理完之后导出png格式图片
  2. 颜色调节

    • 像素值范围调节
      • 如果想增强对比度,应适当调节减小像素值的显示范围
    • 选择colormap
      • 建议选择前四个colormap(jet, turbo, hot, gray), 效果较好
      • 如果对颜色不满意可以用colormap编辑器继续微调
  3. 矩形框选图片中感兴趣区域并放大(暂时仅R2018b及以后的版本可用)

    • 先点 框选ROI按钮,再在图片上拖动矩形框选自己感兴趣的区域

    • 框选区域超出原图片会选取失败,需要重新点击按钮并框选

更新计划

  • 框架
    • 现在使用的MATLAB GUI框架过于笨重,插件还是要依赖庞大的MATLAB本身,导致易用性不足,所以下个版本我准备使用PyQt框架重新开发,完成后就可以打包成单个exe文件,非常轻便易用
  • 功能
    • 增加Batch Mode, 即批处理功能
    • 增加自定义和保存colormap的功能
    • 增加调节图片亮度和对比度的功能
    • 更新ROI选取功能,使较早版本MATLAB也可以使用