/m2-amis-projet

Primary LanguageC

Projet M2 AMIS groupe C

Application de comparaison de structures moléculaire.

  • Utilisation de modélisation des molécules en graphes;
  • Extraction des données de fichier SDF présent sur la base de données ChEBI;
  • Application de l'algorithme de McKay et utilisation de la bibliothèque nauty.c;
  • Construction d'une base de données des groupes d'isomorphes;
  • Comparaison des molécules deux à deux et recherche de MCIS;

Installation et dépendances

Le programme nécessite l'utilisation de :

  • Python3 et C
  • Makefile

Il est favorable de lancer le programme sous Linux.

Pour installer les dépendances de l'application :

  pip install -r requirements.txt

Lancement de l'application

Pour compiler le programme en C et lancer l'application :

  make

Fichier de configuration

Le fichier data/config.json regroupe l'url du fichier SDF de la base de données ChEBI. Cette url peut être remplacée par l'url d'un fichier de molécules de format SDF.