DEsingle_subsampling pre-experiment

目前功能

  • 生成四种基因的数据,并执行DEsingle,将结果保存在./result.csv
  • 将用于生成数据的原始参数以及DEsingle生成的结果保存于./origin_data.csv中,可以直接通过分析R对象record来分析DEsingle的准确率了
  • 输出LoU-细胞数量折线图graph.png

TODO

  • 修改随机生成四种基因数据的参数,目前生成DEa很有问题,生成的DEa数据完全不能被DEsingle发现
  • 根据生成零膨胀负二项分布的两组原始参数来直接判断差异表达类型,以保证数据生成的正确性

用法

修改Script.R中的参数,然后在R终端中执行

source("./Script.R")