DEsingle_subsampling pre-experiment
目前功能
- 生成四种基因的数据,并执行
DEsingle
,将结果保存在./result.csv
中 - 将用于生成数据的原始参数以及
DEsingle
生成的结果保存于./origin_data.csv
中,可以直接通过分析R对象record
来分析DEsingle
的准确率了 - 输出
LoU-细胞数量
折线图graph.png
TODO
- 修改随机生成四种基因数据的参数,目前生成
DEa
很有问题,生成的DEa
数据完全不能被DEsingle
发现 - 根据生成零膨胀负二项分布的两组原始参数来直接判断差异表达类型,以保证数据生成的正确性
用法
修改Script.R
中的参数,然后在R终端中执行
source("./Script.R")