生信的作用越来越大,想学的人越来越多,不管是为了以后发展,还是为了解决眼下的问题。但生信学习不是一朝一夕就可以完成的事情,也许你可以很短时间学会一个交互式软件的操作,却不能看完程序教学视频后就直接写程序。也许你可以跟着一个测序分析流程完成操作,但不懂得背后的原理,不知道什么参数需要修改,结果可以出来,却把握不住对还是错。
学习生信从来就不是一个简单的事,需要做好持久战的心理准备。
在学习时,我们都希望由浅入深的逐步深入,不断地练习和实践,这就是为什么我们需要一本书,因为书很系统。但生信发展的历史短于计算机编程的历史,如果想要一门程序设计的入门数据,每种语言都可以找到几本。但想要一个囊括生信的书,就有些难了。本身生信跨领域,需要多学科的知识,而其内部又有不少分子,都囊括了太大,包括的少又有些隔靴搔痒的感觉。
我们当时都是零基础下自学Linux, 自学Python,自学R,自学高通量测序;这些学习经历,之前都零星地记录在博客里。现在回头去看几年前自己记录的东西,觉得好简单,而当时却费了很大的力气。这些零星的随手记,当时也只是为了自己看,到现在确实只有自己能看得懂,不便惠及更多的人。
因此我们创建了生信宝典,希望从不同的角度传播知识。这个不同有三点含义,一是形式上的不同,摒弃之前主编们单人作战想写啥就写啥,而是有组织有计划的内容聚合,提供一系列的教程,由入门到提高。二是内容的不同,不去用网上现有教程的通用数据做例子,而是拿实际生物数据,讲述如何解释生信中普遍碰到的问题,讲述如何处理自己的数据。三是立足点不同。在写作时,我们回到了当年,在回忆中用整个阶段的学习去指导当初的那个小白,从那些会了的人觉得微不足道而不会的人又迈不过的坎入手,直击痛点。知识点的收录依据不是是否炫酷,是否难,而是是否必要。如果必要,再简单,也要提及;如果不必要,再炫酷,也暂不纳入。
通过大量的生信例子、关键的注释和浓缩的语句形成下面的一系列学习教程。每一篇内容都不多,可以当做小说阅读,也可以跟着去练,反复几遍,每读一次都会有不同的收获和体会。
- 免费Linux系统和生信宝典原创学习教程
- PATH和path,傻傻分不清
- Linux - 总目录
- Linux - 文件和目录
- Linux - 文件操作
- Linux - 文件内容操作
- Linux - 环境变量和可执行属性
- Linux - 管道、标准输入输出
- Linux - 命令运行监测和软件安装
- Linux - 常见错误和快捷操作
- Linux - 文件列太多,很难识别想要的信息在哪列;别焦急,看这里。
- Linux - 文件排序和FASTA文件操作
- Linux - 应用Docker安装软件
- Linux - Conda软件安装方法
- Linux - 服务器数据定期同步和备份方式
- Linux - VIM的强大文本处理方法
- Linux - 查看服务器配置信息
- Linux - SED操作,awk的姊妹篇
- Linux - 常用和不太常用的实用awk命令
- Linux - 那些查找命令
- Linux - 原来你是这样的软连接
- Bash概论 - Linux系列教程补充篇
- Nature Method:Bioconda解决生物软件安装的烦恼
- Linux下文件内容更新了文件夹时间戳却没变?
- 如何获取目标基因的转录因子(上)——Biomart下载基因和motif位置信息
- 如何获取目标基因的转录因子(下)——Linux命令获取目标基因TF
- 生信人写程序1. Perl语言模板及配置
- 生信人写程序2. Editplus添加Perl, Shell, R, markdown模板和语法高亮
- 手把手教你生信分析平台搭建
- Windows轻松实现linux shell环境:gitforwindows
- 开启win10内置Linux子程序
- Docker的基本使用-Ubuntu18.04
- Linux命令screen—终端切换,工作环境保存,画面同步,防断网
- Bioconda软件安装神器:多版本并存、环境复制、环境导出
- 收藏(附中奖信息) | 15 个你非了解不可的 Linux 特殊字符,妈妈再也不用担心我看不懂这些符号了!
- 有了这些,文件批量重命名还需要求助其它工具吗?
- 软件安装不上,可能是网速慢!Conda/R/pip/brew等国内镜像大全拿走不谢~~
- 耗时很长的程序忘加nohup就运行了怎么办?