Este curso está diseñado para quienes buscan un primer acercamiento a R, diseño de scripts y comandos para análisis básicos.
Profesora:
M. en C. Verónica Reyes Galindo
Sábados 10:00am- 1:00pm-. Casa Tlalpan (Juanito House)
Que mis amigüitos aprendan a usar herramientas bioinformaticas para librar los problemas de sus tesis o chamba.
1.- Organicen su proyecto de Tesis o de Vida en un repositorio en GitHub que cuente con las caracteristicas de reproducibilidad que la ciencia requiere.
2.- Descubran métodos bioinformáticos que pueden utilizarse para abordar su proyecto de ciencia.
3.- Realicen análisis y graficos en R que puedan presentar en sus proximos tutorales o articulos.
- Contar con un proyecto que les proporcione datos y de los cuales quieran obtener analisis y graficos.
- Tener datos almacenados en tablas formato excel.
- Contar con una computadora.
La hora de la clase es puntual, para no interferir con nuestras demás actividades. Aquel que llegue tarde debera pagar su retardo con algún incentivo alimenticio para la próxima clase.
Se dejaran lecturas que los participantes deberan leer y comentar en clase. La tarea es aplicar lo que vimos durante la clase en sus datos.
| Mes | Día | Tema | Actividad | # Clase | Tarea |
|---|---|---|---|---|---|
| Enero | 11 | Introducción a la bioinformática/ Introducción a R | Reconocer el ambiente de R/Crear un directorio para sus datos | 1 | Hacer una cuenta en GitHub/ Ordenar datos de tesis o de su vida en una tabla |
| Enero | 18 | Entorno de R | Trabajar en terminal R | 2 | Traer gráficos/análisis que qusieran crear con R |
| Enero | 25 | Operaciones matematicas básicas/ manipulación de datos | Trabajar en terminal R | 3 | |
| Febrero | 1 | Suspensión de clases | Hacer su Tarea | 4 | |
| Febrero | 8 | Vectores, Matrices, Data frame | Trabajar en terminal R | 5 | |
| Febrero | 22 | Listas/ Combinar, cortar y pegar datos | Trabajar en terminal R | 6 | |
| Febrero | 29 | for loops | Trabajar en terminal R | 7 | |
| Marzo | 2 | funciones | Trabajar en terminal R | 8 | |
| Marzo | 9 | Instalar paqueterias y plotear graficos | Trabajar en terminal R | 9 | |
| Marzo | 16 | Exponer sus dudas y gráficos/análisis de interes | Trabajar en terminal R | 10 | |
| Marzo | 23 | Edición de gráficos | Trabajar en terminal R | 11 | |
| Marzo | 30 | Resolver gráficos | Trabajar en terminal R | 12 |