/dicom_tools

关于dicom格式的CT文件的一些脚本

Primary LanguagePythonMIT LicenseMIT

dicom_tools

关于dicom格式的CT文件的一些脚本 将path目录下的dcm文件按照切片深度排序

sort.py

播放path目录下的dcm文件动画(需经过sort排序)

play.py [path]

播放path目录下的dcm文件动画(YZ方向切片,比较慢)

end_wise.py

将dcm文件保存为图片

save_image.py [path | file] --output [output]

将两个dcm序列目录按照成像时间排序为scan_1,scan_2

rename_path.py

将dcm序列根据数据切割成为肿瘤所在位置的多层切片

crop_in_3d.py [option] # 详见--help

包含get_segmented_lungs函数,将CT层图中肺部部分分割并返回

cut_lung.py 

将CT序列层叠,切割分离,并建立3d视图(很慢)

参考资料

plot_3d.py