aandradebio
Bioinformatician - Postdoctoral Fellow at the University of Calgary @IntegrativeViromicsLab
Calgary, Alberta, Canada
Pinned Repositories
biocthis
Automate package and project setup for Bioconductor packages
filterCSVinR
A personal script to subset a bunch of CSV files based on patterns to remove, using R
genocut
This package generates random fragments of k length from a larger sequences in FASTA format without overlap
getSRAdata
Simple code to retrieve reads from the SRA database
getTax
A simple way to retrieve taxonomic information for protein sequences using NCBI's Entrez Utilities.
ML_simposioPGGEN
Disponibilização das aulas práticas ministradas no minicurso de Introdução a Aprendizagem de máquina para a Bioinformática.
V2IDA
Viral Vaccine genetic Diversity Analyzer
genocut
This package generates random fragments of k length from a larger sequences in FASTA format without overlap
mnmer
MosViR
aandradebio's Repositories
aandradebio/V2IDA
Viral Vaccine genetic Diversity Analyzer
aandradebio/ML_simposioPGGEN
Disponibilização das aulas práticas ministradas no minicurso de Introdução a Aprendizagem de máquina para a Bioinformática.
aandradebio/mnmer
aandradebio/biocthis
Automate package and project setup for Bioconductor packages
aandradebio/filterCSVinR
A personal script to subset a bunch of CSV files based on patterns to remove, using R
aandradebio/getSRAdata
Simple code to retrieve reads from the SRA database
aandradebio/getTax
A simple way to retrieve taxonomic information for protein sequences using NCBI's Entrez Utilities.
aandradebio/splitFASTA
Simple code to split a multifasta file using R
aandradebio/MinicursoR_PGGEN
Este repositório foi criado para guardar os scripts e as aulas relacionadas ao Minicurso de Exploração e Visualização de dados biológicos em R, que será ministrado no Simpósio da PGGEN (UFRJ) no período de 27 a 29 de Setembro de 2023.
aandradebio/RResamplingFASTA
Simple Rscript to resample large fasta files