Приложения к книге "Статистический анализ и визуализация данных с помощью R"
Этот репозиторий содержит файлы скриптов на языке R и наборы данных, необходимые для воспроизведения примеров из книги Мастицкий С.Э., Шитиков В.К. "Статистический анализ и визуализация данных с помощью R". Данное пособие обобщает серию методических статей по R, опубликованных в блоге "R: Анализ и визуализация данных", а также включает несколько специально написанных дополнительных разделов. Впервые книга была опубликована в декабре 2014 г. в электронном виде в рамках лицензии Creative Commons "Атрибуция - Некоммерческое использование - На тех же условиях 4.0 Всемирная". Летом 2015 г. в издательстве "ДМК Пресс" (Москва) вышла также печатная версия этой книги, с исправлениями и новыми дополнениями. Опубликованная ранее электронная версия по-прежнему будет распространяться бесплатно, однако какое-либо дальнейшее ее радактирование не планируется.
Репозиторий разбит на две директории в соответствии с годом издания книги - Edition_2014 и Edition_2015. Обе эти директории имеют следующую одинаковую структуру (хотя содержание отдельных файлов в них несколько различается):
- В папке
Bookхранится PDF-файл книги (для издания 2015 г. доступен только файл с содержанием, предисловием и частью 1-й главы). - Папка
Scriptsвключает скрипты с примерами кода. Каждый скрипт соответствует одной из 9 глав. Имена этих файлов состоят изCh_(от chapter - "глава") и порядковогономераглавы (например,Ch_1.R). Кроме того, в этой папке хранится скриптKendall_Theil_Regr.R, код в котором определяет функцию для выполнения регрессионного анализа по методу Кендалла-Тейла. - Папка
Dataсодержит наборы данных, используемых в книге. В частности, в ней представлены следующие файлы:
| Файл | Описание |
|---|---|
sleep_imp.Rdata |
Сон животных: набор данных sleep из пакета VIM после заполнения пропусков |
wader.txt |
Пример из работы Zuur et al. (2010) по двум видам птиц |
SparrowsElphick.txt |
Пример из работы Zuur et al. (2010) по воробьям |
55.45N-36.85E-TAVG-Trend.txt |
Среднемесячные температуры в Москве (оригинал Berkeley Earth) |
TAVG_Moscow.txt |
Среднемесячные температуры в Москве (преобразованные данные, 3 столбца) |
TAVG_Moscow.RData |
Среднемесячные температуры в Москве (данные в матричной форме) |
Гадюки.txt |
Данные по смертности мышей при введении яда гадюки |
dreissena_infection.txt |
Данные по зараженности моллюска Dreissena (сгруппированные) |
dreissena_infection_raw_data.txt |
Данные по зараженности моллюска Dreissena (исходные) |
Elton_TolInt.txt |
Соленость воды и численность видов бентоса в реках Приэльтонья |
RIKZ.txt |
Данные по морским животным из книги Zuur et al. (2009) |
maps.yandex.ru.JPG |
Карта для нанесения местообитаний гадюк |
13.txt |
Данные Н.Чижиковой для анализа пространственного расположения растений |
С вопросами и предложениями по поводу содержания этого репозитория обращайтесь, пожалуйста, по электронной почте.