Dieser Ordner enthält drei Jupyter-Notebooks für die Arbeit im Praktikum. Ich habe Sie auf einem Ubuntu-Linux Version 21.10 (ubuntu-21.10-desktop-amd64.iso) mit einer Minimalinstallation getestet.
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2022_book_biogas_project.ipynb -> für die Biogas-Aufgabe
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seq-assembly.ipynb -> für das Assembly der Sequence Reads
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fast2tab.awk -> AWK script converting Fasta to TAB file
Dieses Notebook benötigen Sie nicht:
- book_biogas_project.ipynb -> für die Biogas-Aufgabe, aber mit einem älteren Linuxsystem