agilent UV converter reports wavelengths incorrectly
ethanbass opened this issue · 2 comments
The Agilent UV converter seems to just output the first value repeatedly in the "wavelength" column (though it is in fact reporting different values). For example, here is the first few lines of the output from the example file: entab -i ~/entab/entab/tests/data/carotenoid_extract.d/dad1.uv
(I think these are actually the absorbance values for different wavelengths, but they all say 200 under the wavelength column).
time wavelength intensity
0.0013333333333333333 200 -15.6675
0.0013333333333333333 200 -31.805
0.0013333333333333333 200 -35.3695
0.0013333333333333333 200 -28.8505
0.0013333333333333333 200 -21.1925
0.0013333333333333333 200 -14.8475
0.0013333333333333333 200 -10.1245
0.0013333333333333333 200 -6.801
0.0013333333333333333 200 -4.542
0.0013333333333333333 200 -3.031
0.0013333333333333333 200 -2.035
0.0013333333333333333 200 -1.3765
0.0013333333333333333 200 -0.933
0.0013333333333333333 200 -0.6475
It looks like it was never actually updating the wavelength when it was running and the test stopped after checking the first value. 🙃
This should be fixed now and the test is updated to check at least the first two values as of 2c63fde. Thanks for finding this bug!
great. the new patch seems to have solved this 👍