Crée à partir des scripts de Pierre, l'application prend en compte 4 fichiers en entrée. Elle applique une normalisation log(cpm) sur les données puis crée diverses visualisations descriptives.
- Liste des gènes essentiels, contenus dans une colonne au format texte, sans header.
- Liste des gènes non-essentiels, contenus dans une colonne au format texte, sans header.
- Table de comptage au format csv. Les rownames correspondent aux noms de guides, les colnames aux échantillons.
- Fichier de description des échantillons contentant une seule colonne au format texte. Respectant le format suivant: SAMPLENAME|Réplica-celltype-timepoint...