/cluster_Lad_Cobra

Primary LanguageC

Aplicación para operaciones básicas en una matriz de 900x900 usando cluster vía Ethernet en una Red LAN.

Configuración Clúster MPI en Ubuntu.

Primero necesitamos 3 máquinas, con sistema operativo GNU/Linux. Para este caso usaremos Ubuntu 13.10. A su vez, el nombre de usuario de cada nodo, deben llamarse EXACTAMENTE IGUAL. Usaremos el nombre "cluster" (sin comillas). Al mismo tiempo definiermos cada nodo con un nombre de máquina propio.

  • Nombre equipo maestro: n13 Ip maestro: 10.1.10.113
  • Nombre equipo esclavo: n14 Ip maestro: 10.1.10.114
  • Nombre equipo esclavo: n15 Ip maestro: 10.1.10.115

Nodo Esclavo

Paso 1: actualización de SO e instalación de programas a utilizar

sudo apt-get update

sudo apt-get upgrade

sudo apt-get install gcc g++

sudo apt-get install openmpi-bin openmpi-common

libopenmpi1.3 libopenmpi-dev

sudo apt-get install ssh

sudo apt-get install nfs-kernel-server nfs-common portmap

sudo apt-get install build-essential

Paso 2: Creación de carpeta a compartir

  • Posicionarse en carpeta cluster
cd /home/ cluster

mkdir .ssh

sudo chmod 777 .ssh

cd ../../

sudo mkdir /mpi

sudo chmod 777 /mpi

cd /mpi

sudo chown user /mpi

Paso 3: Montaje de carpeta maestra.

  • Montar carpeta maestra compartida y en cada nodo cliente ejecutar:
sudo mount 10.1.10.113:/mpi /mpi


sudo gedit /etc/fstab
  • Y escribir
10.1.10.113:/mpi /mpi nfs
  • Luego
sudo mount –a

Nodo maestro

Paso 1: actualización de SO e instalación de programas a utilizar

sudo apt-get update

sudo apt-get upgrade

sudo apt-get install gcc g++

sudo apt-get install openmpi-bin openmpi-common

libopenmpi1.3 libopenmpi-dev

sudo apt-get install ssh

sudo apt-get install nfs-kernel-server nfs-common portmap

sudo apt-get install build-essential

Paso 2: Creación de carpeta a compartir

  • Posicionarse en carpeta cluster
cd /home/ cluster

mkdir .ssh

sudo chmod 777 .ssh

cd ../../

sudo mkdir /mpi

sudo chmod 777 /mpi

cd /mpi

sudo chown user /mpi

Paso 3: Editar ficheros hosts y exports

sudo gedit /etc/hosts
  • Y escribimos lo siguiente
127.0.0.1 localhost

# “ip” “usuario” “equipo”
10.1.10.113 cluster n13 # nodo maestro
10.1.10.014 cluster n14 # nodo esclavo 1
10.1.10.015 cluster n15 # nodo esclavo 2

# The following lines are desirable for IPv6 capable hosts
::1 ip6-localhost ip6-loopback
  • Luego
sudo gedit /etc/exports
  • Y escribimos lo suiguiente
# /etc/exports: the access control list for filesystems which may
be exported
# to NFS clients. See exports(5).
gss/krb5i(rw,sync,fsid=0,crossmnt,no_subtree_check)
# /srv/nfs4/homes gss/krb5i(rw,sync,no_subtree_check )
/mpi *(rw,sync)

Paso 4: Compartición de directorio con nodos esclavo.

 sudo service nfs-kernel-server restart

__ ESPERAR A QUE LOS ESCLAVOS MONTEN LA CARPETA __

  • Luego
ssh-keygen -t rsa
  • Posicionarse en carpeta .ssh
cd /home/cluster/.ssh

cat id_rsa.pub >> authorized_keys
ssh-copy-id 10.1.10.114
ssh-copy-id 10.1.10.115
  • Confirmar si el proceso es correcto
ssh 10.1.10.114

Al ingresar al nodo esclavo este no debe pedir contraseña.

Paso 6: Ejecutar Código.

-Ingresar a carpeta maestra

cd /mpi

-Clonamos el repositorio e ingresamos a este

git clone https://github.com/cris-gar/cluster_Lad_Cobra

cd /mpi/cluster_Lad_Cobra

-Compilar

mpicc <nomArchivo>.c -o <nomAliasArchivo>

-Ejecutar programa

mpirun -np <numero de hilos> --hostfile /home/hostfile ./<nomAliasArchivo>
  • Para revisar el estado de distribuición de carga, recomendamos utilizar htop. Se puede instalar como:
sudo apt-get install htop