Bioconvert 是一个协作项目,旨在促进生命科学里的数据从一种格式到另一种格式的相互转换。
contributions: | Want to add a convertor ? Please join bioconvert#1 |
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issues: | Please use https://github.com/bioconvert/bioconvert/issues |
可以使用 pip 安装bioconvert:
pip install bioconvert
同时,原作者提供了在bioconda (http://bioconda.github.io/)上的发行版:
conda install bioconvert
同时在Singularity container上同样可用。参考以下链接 http://bioconvert.readthedocs.io/en/master/user_guide.html#installation 以了解更多。
bioconvert fastq2fasta input.fastq output.fasta bioconvert gz2dsrc input.fq.gz output.dsrc2 bioconvert bam2bed input.bam output.bed bioconvert --help