python brat2json.py --input /path/to/brat/dir --out_path /path/to/out

входная папка должна содержать в себе две папки: "original" c файлами аннотаций и "text" с txt файлами

python json2conll --in_json /path/to/json --out_conll /path/to/out/file --vocab_file /path/to/vocab --lower_case True --entity сущности через запятую