Para generar los informes reproducibles creados por este repositorio,
necesitamos instalar los paquetes tidyverse, gganimate, ggrepel.
rmarkdown, gifski y lubridate. Sin embargo si instalas los
paquetes pacman y rmarkdown, abres el documento README.Rmd
y
apretas el botton Knit, el script se ocupará de instalar los
paquetes necesarios, para eso solo tienes que correr esto en tu consola:
install.packages("rmarkdown")
install.packages("pacman")
En este repositorio, lo único que necesitas hacer es en la linea 36 de codigo, cambiar las comunas que aparecen como ejemplo por las que quieras visualizar, y esto generará un GIF con la evolución de la prevalencia de casos activos para las comunas seleccionadas y un informe en PDF con las tendencias de la últimas dos semanas. Debes escribir los nombres de las comunas tal y como aparecen en la tabla que aparece al final de este documento:
Comunas <- c("Punta Arenas", "La Florida", "Vina del Mar", "Nunoa", "Valparaiso", "Concon", "Talagante", "San Bernardo", "Macul", "Las Condes", "Valdivia")
Una vez que hayas cambiado las comunas de la linea 42, y apretes Knit, aparecera un HTML con el gif de las comunas que seleccionaste:
Este está actualizado en el último informe epidemiológico, la última fecha includia fué 2020-12-18, a continuación vemos una tabla con las 5 comunas con mas casos en la útlitma fecha disponible:
Region |
Codigo region |
Comuna |
Codigo comuna |
Poblacion |
Fecha |
Activos |
Activos_por_100.000 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
Magallanes y la Antartica |
12 |
Punta Arenas |
12101 |
141984 |
2020-12-18 |
420 |
295.80798 |
Los Rios |
14 |
Valdivia |
14101 |
176774 |
2020-12-18 |
416 |
235.32872 |
Valparaiso |
05 |
Concon |
05103 |
45889 |
2020-12-18 |
36 |
78.45017 |
Metropolitana |
13 |
Macul |
13118 |
134635 |
2020-12-18 |
99 |
73.53214 |
Valparaiso |
05 |
Valparaiso |
05101 |
315732 |
2020-12-18 |
220 |
69.67935 |
En la siguiente tabla se ordenen las comunas en orden acendente según la tendencia de aumento de casos activos por cada 100.000 habitantes en las últimas dos semanas, si los valores son negativos, esto implica una disminución y si son positivos un aumento de casos.
Aumento por día |
Comuna |
---|---|
-0.2587140 |
Talagante |
0.5411137 |
Valparaiso |
0.6610266 |
San Bernardo |
0.7333246 |
La Florida |
0.7848891 |
Las Condes |
0.7878069 |
Vina del Mar |
0.9933739 |
Nunoa |
1.3184172 |
Valdivia |
1.7756738 |
Punta Arenas |
2.2998422 |
Concon |
2.9359147 |
Macul |
Region |
Comuna |
---|---|
Arica y Parinacota |
Arica |
Arica y Parinacota |
Camarones |
Arica y Parinacota |
General Lagos |
Arica y Parinacota |
Putre |
Arica y Parinacota |
Desconocido Arica y Parinacota |
Tarapaca |
Alto Hospicio |
Tarapaca |
Camina |
Tarapaca |
Colchane |
Tarapaca |
Huara |
Tarapaca |
Iquique |
Tarapaca |
Pica |
Tarapaca |
Pozo Almonte |
Tarapaca |
Desconocido Tarapaca |
Antofagasta |
Antofagasta |
Antofagasta |
Calama |
Antofagasta |
Maria Elena |
Antofagasta |
Mejillones |
Antofagasta |
Ollague |
Antofagasta |
San Pedro de Atacama |
Antofagasta |
Sierra Gorda |
Antofagasta |
Taltal |
Antofagasta |
Tocopilla |
Antofagasta |
Desconocido Antofagasta |
Atacama |
Alto del Carmen |
Atacama |
Caldera |
Atacama |
Chanaral |
Atacama |
Copiapo |
Atacama |
Diego de Almagro |
Atacama |
Freirina |
Atacama |
Huasco |
Atacama |
Tierra Amarilla |
Atacama |
Vallenar |
Atacama |
Desconocido Atacama |
Coquimbo |
Andacollo |
Coquimbo |
Canela |
Coquimbo |
Combarbala |
Coquimbo |
Coquimbo |
Coquimbo |
Illapel |
Coquimbo |
La Higuera |
Coquimbo |
La Serena |
Coquimbo |
Los Vilos |
Coquimbo |
Monte Patria |
Coquimbo |
Ovalle |
Coquimbo |
Paiguano |
Coquimbo |
Punitaqui |
Coquimbo |
Rio Hurtado |
Coquimbo |
Salamanca |
Coquimbo |
Vicuna |
Coquimbo |
Desconocido Coquimbo |
Valparaiso |
Algarrobo |
Valparaiso |
Cabildo |
Valparaiso |
Calera |
Valparaiso |
Calle Larga |
Valparaiso |
Cartagena |
Valparaiso |
Casablanca |
Valparaiso |
Catemu |
Valparaiso |
Concon |
Valparaiso |
El Quisco |
Valparaiso |
El Tabo |
Valparaiso |
Hijuelas |
Valparaiso |
Isla de Pascua |
Valparaiso |
Juan Fernandez |
Valparaiso |
La Cruz |
Valparaiso |
La Ligua |
Valparaiso |
Limache |
Valparaiso |
Llaillay |
Valparaiso |
Los Andes |
Valparaiso |
Nogales |
Valparaiso |
Olmue |
Valparaiso |
Panquehue |
Valparaiso |
Papudo |
Valparaiso |
Petorca |
Valparaiso |
Puchuncavi |
Valparaiso |
Putaendo |
Valparaiso |
Quillota |
Valparaiso |
Quilpue |
Valparaiso |
Quintero |
Valparaiso |
Rinconada |
Valparaiso |
San Antonio |
Valparaiso |
San Esteban |
Valparaiso |
San Felipe |
Valparaiso |
Santa Maria |
Valparaiso |
Santo Domingo |
Valparaiso |
Valparaiso |
Valparaiso |
Villa Alemana |
Valparaiso |
Vina del Mar |
Valparaiso |
Zapallar |
Valparaiso |
Desconocido Valparaiso |
Metropolitana |
Alhue |
Metropolitana |
Buin |
Metropolitana |
Calera de Tango |
Metropolitana |
Cerrillos |
Metropolitana |
Cerro Navia |
Metropolitana |
Colina |
Metropolitana |
Conchali |
Metropolitana |
Curacavi |
Metropolitana |
El Bosque |
Metropolitana |
El Monte |
Metropolitana |
Estacion Central |
Metropolitana |
Huechuraba |
Metropolitana |
Independencia |
Metropolitana |
Isla de Maipo |
Metropolitana |
La Cisterna |
Metropolitana |
La Florida |
Metropolitana |
La Granja |
Metropolitana |
La Pintana |
Metropolitana |
La Reina |
Metropolitana |
Lampa |
Metropolitana |
Las Condes |
Metropolitana |
Lo Barnechea |
Metropolitana |
Lo Espejo |
Metropolitana |
Lo Prado |
Metropolitana |
Macul |
Metropolitana |
Maipu |
Metropolitana |
Maria Pinto |
Metropolitana |
Melipilla |
Metropolitana |
Nunoa |
Metropolitana |
Padre Hurtado |
Metropolitana |
Paine |
Metropolitana |
Pedro Aguirre Cerda |
Metropolitana |
Penaflor |
Metropolitana |
Penalolen |
Metropolitana |
Pirque |
Metropolitana |
Providencia |
Metropolitana |
Pudahuel |
Metropolitana |
Puente Alto |
Metropolitana |
Quilicura |
Metropolitana |
Quinta Normal |
Metropolitana |
Recoleta |
Metropolitana |
Renca |
Metropolitana |
San Bernardo |
Metropolitana |
San Joaquin |
Metropolitana |
San Jose de Maipo |
Metropolitana |
San Miguel |
Metropolitana |
San Pedro |
Metropolitana |
San Ramon |
Metropolitana |
Santiago |
Metropolitana |
Talagante |
Metropolitana |
Tiltil |
Metropolitana |
Vitacura |
Metropolitana |
Desconocido Metropolitana |
Del Libertador General Bernardo O’Higgins |
Chepica |
Del Libertador General Bernardo O’Higgins |
Chimbarongo |
Del Libertador General Bernardo O’Higgins |
Codegua |
Del Libertador General Bernardo O’Higgins |
Coinco |
Del Libertador General Bernardo O’Higgins |
Coltauco |
Del Libertador General Bernardo O’Higgins |
Donihue |
Del Libertador General Bernardo O’Higgins |
Graneros |
Del Libertador General Bernardo O’Higgins |
La Estrella |
Del Libertador General Bernardo O’Higgins |
Las Cabras |
Del Libertador General Bernardo O’Higgins |
Litueche |
Del Libertador General Bernardo O’Higgins |
Lolol |
Del Libertador General Bernardo O’Higgins |
Machali |
Del Libertador General Bernardo O’Higgins |
Malloa |
Del Libertador General Bernardo O’Higgins |
Marchihue |
Del Libertador General Bernardo O’Higgins |
Mostazal |
Del Libertador General Bernardo O’Higgins |
Nancagua |
Del Libertador General Bernardo O’Higgins |
Navidad |
Del Libertador General Bernardo O’Higgins |
Olivar |
Del Libertador General Bernardo O’Higgins |
Palmilla |
Del Libertador General Bernardo O’Higgins |
Paredones |
Del Libertador General Bernardo O’Higgins |
Peralillo |
Del Libertador General Bernardo O’Higgins |
Peumo |
Del Libertador General Bernardo O’Higgins |
Pichidegua |
Del Libertador General Bernardo O’Higgins |
Pichilemu |
Del Libertador General Bernardo O’Higgins |
Placilla |
Del Libertador General Bernardo O’Higgins |
Pumanque |
Del Libertador General Bernardo O’Higgins |
Quinta de Tilcoco |
Del Libertador General Bernardo O’Higgins |
Rancagua |
Del Libertador General Bernardo O’Higgins |
Rengo |
Del Libertador General Bernardo O’Higgins |
Requinoa |
Del Libertador General Bernardo O’Higgins |
San Fernando |
Del Libertador General Bernardo O’Higgins |
San Vicente |
Del Libertador General Bernardo O’Higgins |
Santa Cruz |
Del Libertador General Bernardo O’Higgins |
Desconocido O’Higgins |
Maule |
Cauquenes |
Maule |
Chanco |
Maule |
Colbun |
Maule |
Constitucion |
Maule |
Curepto |
Maule |
Curico |
Maule |
Empedrado |
Maule |
Hualane |
Maule |
Licanten |
Maule |
Linares |
Maule |
Longavi |
Maule |
Maule |
Maule |
Molina |
Maule |
Parral |
Maule |
Pelarco |
Maule |
Pelluhue |
Maule |
Pencahue |
Maule |
Rauco |
Maule |
Retiro |
Maule |
Rio Claro |
Maule |
Romeral |
Maule |
Sagrada Familia |
Maule |
San Clemente |
Maule |
San Javier |
Maule |
San Rafael |
Maule |
Talca |
Maule |
Teno |
Maule |
Vichuquen |
Maule |
Villa Alegre |
Maule |
Yerbas Buenas |
Maule |
Desconocido Maule |
Nuble |
Bulnes |
Nuble |
Chillan |
Nuble |
Chillan Viejo |
Nuble |
Cobquecura |
Nuble |
Coelemu |
Nuble |
Coihueco |
Nuble |
El Carmen |
Nuble |
Ninhue |
Nuble |
Niquen |
Nuble |
Pemuco |
Nuble |
Pinto |
Nuble |
Portezuelo |
Nuble |
Quillon |
Nuble |
Quirihue |
Nuble |
Ranquil |
Nuble |
San Carlos |
Nuble |
San Fabian |
Nuble |
San Ignacio |
Nuble |
San Nicolas |
Nuble |
Treguaco |
Nuble |
Yungay |
Nuble |
Desconocido Nuble |
Biobio |
Alto Biobio |
Biobio |
Antuco |
Biobio |
Arauco |
Biobio |
Cabrero |
Biobio |
Canete |
Biobio |
Chiguayante |
Biobio |
Concepcion |
Biobio |
Contulmo |
Biobio |
Coronel |
Biobio |
Curanilahue |
Biobio |
Florida |
Biobio |
Hualpen |
Biobio |
Hualqui |
Biobio |
Laja |
Biobio |
Lebu |
Biobio |
Los Alamos |
Biobio |
Los Angeles |
Biobio |
Lota |
Biobio |
Mulchen |
Biobio |
Nacimiento |
Biobio |
Negrete |
Biobio |
Penco |
Biobio |
Quilaco |
Biobio |
Quilleco |
Biobio |
San Pedro de la Paz |
Biobio |
San Rosendo |
Biobio |
Santa Barbara |
Biobio |
Santa Juana |
Biobio |
Talcahuano |
Biobio |
Tirua |
Biobio |
Tome |
Biobio |
Tucapel |
Biobio |
Yumbel |
Biobio |
Desconocido Biobio |
La Araucania |
Angol |
La Araucania |
Carahue |
La Araucania |
Cholchol |
La Araucania |
Collipulli |
La Araucania |
Cunco |
La Araucania |
Curacautin |
La Araucania |
Curarrehue |
La Araucania |
Ercilla |
La Araucania |
Freire |
La Araucania |
Galvarino |
La Araucania |
Gorbea |
La Araucania |
Lautaro |
La Araucania |
Loncoche |
La Araucania |
Lonquimay |
La Araucania |
Los Sauces |
La Araucania |
Lumaco |
La Araucania |
Melipeuco |
La Araucania |
Nueva Imperial |
La Araucania |
Padre Las Casas |
La Araucania |
Perquenco |
La Araucania |
Pitrufquen |
La Araucania |
Pucon |
La Araucania |
Puren |
La Araucania |
Renaico |
La Araucania |
Saavedra |
La Araucania |
Temuco |
La Araucania |
Teodoro Schmidt |
La Araucania |
Tolten |
La Araucania |
Traiguen |
La Araucania |
Victoria |
La Araucania |
Vilcun |
La Araucania |
Villarrica |
La Araucania |
Desconocido Araucania |
Los Rios |
Corral |
Los Rios |
Futrono |
Los Rios |
La Union |
Los Rios |
Lago Ranco |
Los Rios |
Lanco |
Los Rios |
Los Lagos |
Los Rios |
Mafil |
Los Rios |
Mariquina |
Los Rios |
Paillaco |
Los Rios |
Panguipulli |
Los Rios |
Rio Bueno |
Los Rios |
Valdivia |
Los Rios |
Desconocido Los Rios |
Los Lagos |
Ancud |
Los Lagos |
Calbuco |
Los Lagos |
Castro |
Los Lagos |
Chaiten |
Los Lagos |
Chonchi |
Los Lagos |
Cochamo |
Los Lagos |
Curaco de Velez |
Los Lagos |
Dalcahue |
Los Lagos |
Fresia |
Los Lagos |
Frutillar |
Los Lagos |
Futaleufu |
Los Lagos |
Hualaihue |
Los Lagos |
Llanquihue |
Los Lagos |
Los Muermos |
Los Lagos |
Maullin |
Los Lagos |
Osorno |
Los Lagos |
Palena |
Los Lagos |
Puerto Montt |
Los Lagos |
Puerto Octay |
Los Lagos |
Puerto Varas |
Los Lagos |
Puqueldon |
Los Lagos |
Purranque |
Los Lagos |
Puyehue |
Los Lagos |
Queilen |
Los Lagos |
Quellon |
Los Lagos |
Quemchi |
Los Lagos |
Quinchao |
Los Lagos |
Rio Negro |
Los Lagos |
San Juan de la Costa |
Los Lagos |
San Pablo |
Los Lagos |
Desconocido Los Lagos |
Aysen |
Aysen |
Aysen |
Chile Chico |
Aysen |
Cisnes |
Aysen |
Cochrane |
Aysen |
Coyhaique |
Aysen |
Guaitecas |
Aysen |
Lago Verde |
Aysen |
OHiggins |
Aysen |
Rio Ibanez |
Aysen |
Tortel |
Aysen |
Desconocido Aysen |
Magallanes y la Antartica |
Antartica |
Magallanes y la Antartica |
Cabo de Hornos |
Magallanes y la Antartica |
Laguna Blanca |
Magallanes y la Antartica |
Natales |
Magallanes y la Antartica |
Porvenir |
Magallanes y la Antartica |
Primavera |
Magallanes y la Antartica |
Punta Arenas |
Magallanes y la Antartica |
Rio Verde |
Magallanes y la Antartica |
San Gregorio |
Magallanes y la Antartica |
Timaukel |
Magallanes y la Antartica |
Torres del Paine |
Magallanes y la Antartica |
Desconocido Magallanes |