InterProScanをスパコンで実行
#!/bin/sh
#$ -S /bin/sh
#$ -cwd
singularity exec /usr/local/biotools/i/interproscan\:5.55_88.0--hec16e2b_1 interproscan.sh -i /home/hoge/Inter/protein.faa -b /home/hoge/Inter/
コンテナ内に参照データが同梱されてないので上記のやり方では駄目。
参照DBのディレクトリをコンテナにバインドする必要がある点に注意
InterProScanの結果からGO組成に変換
perl ./InterPro2GOTransfer.pl protein.faa.tsv interpro2go
GO組成からメタゲノムGO Slim に載っているGOのみに限定して組成計算
perl ./GOSlimMeta.pl protein.faa.tsv.go.tsv goslim_metagenomics.obo