/pythonHOT

Structural EM algorithm for inferring pytholgenic trees.

Primary LanguagePython

Lab 3
Structural EM algorithm for inferring pytholgenic trees.

Frågor till Jens: 
1. Vid uppskapande av träd, hur sätter man error variablerna? 
2. Beräknar man CPD för Z samt X eller bara Z? Var finns det beskrivet i sådana fall? 
3. Ska beräkningen av vikterna, se botten av sida 7, maximera fölande uttryck eller ska vikterna vara uttrycket? Är det en typo, b istället för a? CPD för X?! 
4. Justerar man Z och X eller bara Z? 
5. Hur kan man felsöka algortmen?
6. Hur kan man implementera en komplett graph?
7. Hur utför man enklast edmunds algorithm? 
8. Har Px för rooten värde 1?
9. Varför inte bara justera trädet tills du finner det med lägst logL?
10. Ska arcvikten någonsin kunna bli längre för en annat träd än ursprungsträdet?