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Calculando Rt do Covid-19 no Brasil

Primary LanguageJupyter Notebook

Covid-19 Rt para o Brasil

por Fernando Serboncini (20 de Abril de 2020)

Utilizando o modelo criado por Kevin Systrom para rt.live.

O que é R_t?

R_t é a taxa de transmissão do vírus no tempo. O número representa, dado uma infecção por Covid-19, qual o número de novas pessoas que serão na média infectadas. Se R_t = 1, o número de infectados permanece constante no tempo (cada infectado infecta mais uma pessoa). Se R_t > 1, o vírus está em crescimento exponencial.

As medidas de isolamento existem para manter R_t baixo. Um número R_t < 1 significa que as medidas estão funcionando.

formula

Mudanças no modelo original

Dados obtidos no site covid.saude.gov.br.

O modelo original usa o número de casos confirmados para determinar R_t. O número de casos no Brasil é muito instável pois varia com a política de testes.

Apesar de o número de mortes também poder estar sub (ou super) estimado, a metodologia não se alterou, o que faz a relação dinâmica funcionar melhor.

Para isso, utilizamos uma predição do número de casos baseado no número de mortes, e só usamos os valores de número de casos, para os dias em que não é possível predizer.

Resultados

O notebook do estudo encontra-se aqui.

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