/labelme-for-dicom

使得labelme能够看和标注ct图像。

Primary LanguagePythonOtherNOASSERTION

labelme用作CT图像的工具

代码全部来自原版的labelme，这里我只是做基础的改动。

改动点

原版labelme写的太好了，很多用户想要的功能其实都有，这里就暂时改动了几处。

  1. 能够读取ct图像，但是不能读取连续帧的dicom图像，即只能读单独ct，后缀为dcm的文件。目前做过一版能够读连续帧的，例如超声dicom和avi格式图像，但是目前不方便释放。

  2. 增加窗宽窗位的修改。

  3. 将translate和default_config.yaml 放在同exe目录下，因为配置参数的问题。新增了一些ct值范围的设置参数，这样的话利于随时修改，不用去用户目录下找。因为工作中有的人不擅长找这个配置文件的位置。

  4. 将原版labelme的复制模式（ctrl+p）的按钮也放到了工具菜单栏上，这个功能替代以前开发的导入上一个下一个功能。这样的话和和原版labelme逻辑上是一致的。即打开这个功能，推到下一张图片，会自动带上上一张图片的标注。（以前导入上一个下一个是因为一个系列的ct图像一般中间比较大，可以从中间往两边复制，变化较小，这样标注快，所以有这个逻辑。但是原版labelme就有，这样也可以从中间开始标注，然后在想要复制的图标注打开这个功能。）

  5. 应该同时也能够读基础图像文件了。

创建独立的app

python暂时使用3.8，好像3.9以上有些问题，不知道是不是其他包冲突的问题。我自己打包了一个windows的，在releases中可查看到。

# Setup conda
conda create --name labelme python=3.8
conda activate labelme

# Build the standalone executable
pip install .
pip install 'matplotlib==3.2.0'
pip install gdcm pydicom
pip install pyinstaller
pyinstaller labelme.spec
dist/labelme --version