Pinned Repositories
custom_scripts
custom_scripts_for_blast
d2l-zh
《动手学深度学习》：面向中文读者、能运行、可讨论。中英文版被60多个国家的400多所大学用于教学。
deeplearningbook-chinese
Deep Learning Book Chinese Translation
m5U_Detector
V1
m6A-seq
multiPrime
multiPrime is a mismatch-tolerant minimal primer set design tool for large and diverse sequences (e.g. Virus). Here is a web-based version (test: http://multiPrime.cn))
multiPrime2-GUI
multiPrime2-GUI: Designing degenerate primers for maximum coverage with minimal degeneracy.
Nm_Detector
Nm_detector pipeline
scripts_for_Metagenome
joybio's Repositories
joybio/multiPrime
multiPrime is a mismatch-tolerant minimal primer set design tool for large and diverse sequences (e.g. Virus). Here is a web-based version (test: http://multiPrime.cn))
joybio/multiPrime2-GUI
multiPrime2-GUI: Designing degenerate primers for maximum coverage with minimal degeneracy.
joybio/ARL
ARL 资产侦察灯塔系统（可运行，添加指纹，提高并发，升级工具及系统，无限制修改版） | ARL(Asset Reconnaissance Lighthouse)资产侦察灯塔系统旨在快速侦察与目标关联的互联网资产，构建基础资产信息库。 协助甲方安全团队或者渗透测试人员有效侦察和检索资产，发现存在的薄弱点和攻击面。
joybio/Augustus
Genome annotation with AUGUSTUS
joybio/cf-mirror
AdySec CF拉平镜像站 | 官方源可信度和稳定性最高，但国内访问速度较慢，通过众生平等Cloudflare，利用全球的边缘节点，将用户请求转发到离用户距离最近的节点，同时缓存静态内容加速，减少网络延迟和下载速度，使用Cloudflare Workers配置反代实现
joybio/DearPyGui
Dear PyGui: A fast and powerful Graphical User Interface Toolkit for Python with minimal dependencies
joybio/fsplit
for split fastq from mix bcl or fastq data by barcode/index
joybio/GEMMA
Genome-wide Efficient Mixed Model Association
joybio/gpt_academic
为GPT/GLM提供图形交互界面，特别优化论文阅读润色体验，模块化设计支持自定义快捷按钮&函数插件，支持代码块表格显示，Tex公式双显示，支持Python和C++等项目剖析&自译解功能，PDF/LaTex论文翻译&总结功能，支持并行问询多种LLM模型，支持清华chatglm等本地模型。兼容复旦MOSS, llama, rwkv, 盘古等。
joybio/graphlan_plot
This script is designed to automate the process of generating circular phylogenetic tree visualizations using Graphlan
joybio/h1_asset
HackerOne资产更新 | 每日更新HackerOne资产，对HackerOne的资产进行爬行和整理，SRC资产更新仅会增加，不会进行删除，每天更新的可以进行差异化对比来获取到新的项目资产范围
joybio/hello-algo
《Hello 算法》：动画图解、一键运行的数据结构与算法教程，支持 Java, C++, Python, Go, JS, TS, C#, Swift, Rust, Dart, Zig 等语言。
joybio/hget
interruptable, resumable download accelerator
joybio/inStrain
Bioinformatics program inStrain
joybio/IP_database
IP地址库 | GeoLite数据库每日更新，纯真ip库每日更新，ip2region每日更新，17monipdb每日更新，ipv6wry每日更新，IPDB每日更新，DB-IP每日更新
joybio/iqtree2
NEW location of IQ-TREE software for efficient phylogenomic software by maximum likelihood http://www.iqtree.org
joybio/joybio
Config files for my GitHub profile.
joybio/Junbo
joybio/Micro_pan_genome
run roary for MAGs within the identical species
joybio/nuclei_poc
Nuclei POC，每日更新 | 自动整合全网Nuclei的漏洞POC，实时同步更新最新POC，保存已被删除的POC。通过批量克隆Github项目，获取Nuclei POC，并将POC按类别分类存放，使用Github Action实现（已有11wPOC，已校验有效性并去重）
joybio/panaroo
An updated pipeline for pangenome investigation
joybio/PyWebIO
Write interactive web app in script way.
joybio/runjob
runjob is a program for managing a group of related jobs running on a compute cluster
joybio/rust-mdbg
minimizer-space de Bruijn graphs (mdBG) for whole genome assembly
joybio/script
VPS测试脚本
joybio/Security_Tools
joybio/TBtools
GUI/CommandLine Tool Box for biologistists to utilize NGS data.
joybio/top_1m_domains
前1M域名列表（alexa替代品）| 免费且可直接下载的前100万域名列表，是Alexa.com服务（已下线）的替代品。这些替代服务提供了在没有Alexa.com的情况下获取top 1m域名数据的解决方案。
joybio/tracker
tracker服务器列表 | BT下载所需tracker服务器，每日聚合tracker服务器列表，对公开tracker服务器进行爬取，并测试存活后写入列表中 | trackers_all.txt为全量tracker服务器列表，trackers_best.txt为测试存活服务器列表
joybio/wechat_sqlite
微信sqlite解密 | 从内存中快速搜索指定数据。获取基址+偏移量与特征，从而达到微信版本每次更新不需要重新查找地址。可获取自己电脑上已登录微信的微信号，wxid，手机号，sqlite解密密钥。解密微信sqlite数据库中存放的历史消息记录