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Datos y análisis de datos de pruebas moleculares y casos confirmados en Puerto Rico

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Informes

Pueden ver un resumen aquí

y el codigo aquí

La charla presentada al PRPHT está aquí.

Datos

Todos los datos están en el directorio data

  • Archivos que empiezan con 20_0615 son los datos de los laboratorios moleculares
  • Bioportal molecular tests 7-14-2020.xlsx contiene todas las pruebas en la base de datos del Departamento de salud. No incluye identificador de personas así no se puede remover duplicados.
  • Bioportal tests by collected data_Refresh.xlsx contiene los totales para cada día.
  • Dash Total.xlsxcontine datos de hospitalizaciones.
  • TestingByDate.csv datos de Massachusetts. Para obtener los datos de Massachusetts descargué este archivo zip

unzip y saque el archivo TestingByDate.csv

Los datos extraidos de los datos cruedos están en el directorio rdas

Codigo

  • Para extaer los datos de Puerto Rico pueden correr el archivo wrangle-YYYY-MM-DD.R.

  • prpht.Rmd creo la presentación at PRPHT.

  • wrangle-bioportal-data-2020-07-14.R crea un resumen diario de positivos y pruebas.