Итоговый проект по Биоинформатике, групповая часть
| Участник | Род | Ссылка на индивидуальную часть |
|---|---|---|
| Бардонов Даниил | Leucobacter | https://github.com/dabardonov/hse22_project |
| Васильева Виктория | Bifidobacterium | https://github.com/viktoria210/hse22_project |
| Гильманова Далия | Brevibacterium | https://github.com/da11a/hse22_project |
| Долгодворова Мария | Actinomyces | https://github.com/knapweedss/hse22_project_Actinomyces |
| Коган Евгений | Corynebacterium | https://github.com/mondique/hse22_project |
| Темкин Влад | Gordonia | https://github.com/zlatovladdka/hse22_project |
| Шишкин Михаил | Cellulomonas | https://github.com/TesMichelle/hse22_project_minor |
| Ширма Кирилл | Nocardioides | https://github.com/ruct/hse22_bioinfo_project |
| Валиев Алы | Mycolicibacterium | https://github.com/Kalick153/hse22_project |
| Свинцов Михаил | Microbacterium | https://github.com/SvMixa/hse22_project |
| Богданов Данила | Rhodococcus | https://github.com/Sunflower47/hse22_project |
Кластер 0 (146) response regulator transcription factor:
Белок, который опосредует реакцию клетки на изменения в окружающей среде как часть двухкомпонентной регуляторной системы. Связаны со специфическими гистидинкиназами, которые служат датчиками изменений окружающей среды
Кластер 1 (149) 23S rRNA (guanosine(2251)-2'-O)-methyltransferase RlmB:
Представляет собой фермент с систематическим названием S-аденозил-L-метионин:23S рРНК (гуанозин2251-2'-O-)-метилтрансфераза. Фермент катализирует метилирование гуанозина
Кластер 2 (424) Asp-tRNA(Asn)/Glu-tRNA(Gln) amidotransferase subunit GatA:
Asp-тРНК(Asn)/Glu-тРНК(Gln) субъединица амидотрансферазы GatA, трансфераза
Кластер 3 (406) ATP-dependent DNA helicase RecG:
Играет решающую роль в рекомбинации и репарации ДНК.
Кластер 4 (828) twin-arginine translocase subunit TatC:
Отвечает за экспорт свернутых белков через цитоплазматическую мембрану бактерий.
Кластер 5 (138) phosphoribosylformylglycinamidine synthase subunit PurQ:
Часть фосфорибозилформилглицинамидинсинтазного комплекса, участвующего в пути биосинтеза пурина. Катализирует АТФ-зависимое превращение формилглицинамид рибонуклеотида (FGAR) и глутамина с образованием формилглицинамидин рибонуклеотида (FGAM) и глутамата
Кластер 6 (428) UMP kinase:
Этот фермент относится к семейству трансфераз, в частности к тем, которые переносят фосфорсодержащие группы (фосфотрансферазы) с фосфатной группой в качестве акцептора, и участвует в метаболизме пиримидина.
Кластер 7 (169) NUDIX hydrolase:
Гидролазы NUDIX представляют собой суперсемейство гидролитических ферментов, способных расщеплять нуклеозиддифосфаты, связанные с x (любой фрагмент). Субстраты, гидролизуемые ферментами nudix, включают широкий спектр органических пирофосфатов, включая ди- и трифосфаты нуклеозидов, динуклеозидные и дифосфоинозитол-полифосфаты, нуклеотидные сахара и РНК-шапки с различной степенью специфичности к субстрату
Кластер 8 (111) demethylmenaquinone methyltransferase:
Деметилменахинонметилтрансфераза представляет собой фермент с систематическим названием S-аденозил-L-метионин: деметилменахинонметилтрансфераза. Фермент катализирует последнюю стадию биосинтеза менахинона.
Кластер 9 (479) ribonuclease J:
Прокариотическая рибонуклеаза, присутствующая примерно у половины всех видов бактерий, включая ряд важных патогенов, играет ключевую роль как в процессинге, так и в деградации РНК
Кластер 10 (477) CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase:
CDP-диацилглицерин-глицерин-3-фосфат-3-фосфатидилтрансфераза. Данный белок катализирует первую стадию синтеза кислых фосфолипидов.
6 кластер на большой тепловой карте
