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- 「文章发表」-- 肿瘤免疫浸润分析
- 文章发表：绝经后骨质疏松患者的肠道菌群以及代谢组分析
- 一章书发表：在树结构上展示数据
- 一章书发表：GO语义相似性度量
- 文章发表：解决进化树和数据的输入和输出
- 文章发表：画最好看的核型图
- 文章发表：两种方法在进化树上可视化数据
- 文章发表：Using meshes for MeSH term enrichment and semantic analyses
- 关于多序列比对可视化，我们做了一个包
- DNA序列重组可视化方法
- 助力微生物组学分析--实验室新R包MicrobiotaProcess
- aplot包：让你画出更复杂的图
- 你的页面还少了一点装逼的徽章
- 听说你装不了github的包？
- 拼图？我掐指一算，发现事情没那么简单！
- ggbreak：你们要的坐标轴截断，它来了
- CS0: ChIPseq从入门到放弃
- CS1: ChIPseq简介
- CS2: BED文件
- CS3: peak注释
- CS4：关于ChIPseq注释的几个问题
- CS5: 吃着火锅，唱着歌，还把分析给做了
- CS6: ChIPseeker的可视化方法
- CS7：Genomic coordination的富集性分析（1）
- CS8：Genomic coordination的富集性分析（2）
- CS9: GEO数据挖掘
- CS10: 八卦终结版
- CS番外1：如何定义下游的区间？
- CS番外2: 过滤ChIPseeker注释结果
- CS番外3：更好用，更稳定的upsetplot + vennpie
- CS番外4：自定义注释分类
- ChIPseeker其实支持顺反组的各种测序数据
- why clusterProfiler fails
- 为什么画出来的点比指定的数目要多？
- DAVID分析结果转为enrichResult
- DAVID functional analysis with clusterProfiler
- enrichDAVID支持自定义背景
- SCIENCE文章用了DAVID被吐槽
- Comparison of clusterProfiler and GSEA-P
- 听说你有RNAseq数据却不知道怎么跑GSEA
- leading edge analysis
- 单篇引用超过500了，来了解一下
- use clusterProfiler as an universal enrichment analysis tool
- 功能注释后如何做富集分
- msigdf + clusterProfiler全方位支持MSigDb
- 做学术终究是看脸...
- 软件虽然好用，但没发在高影响因子的期刊上，给你们丢脸了！
- 你那一串差异基因，到底是在哪个组织、哪种细胞中富集？
- 听说富集分析有个概念叫Fold Enrichment
- 拟南芥富集分析
- clusterProfiler事后丸: 转换ID为SYMBO
- 富集分析事后丸：过滤数据
- 用dplyr动词操作富集分析结果
- clusterProfiler优化: 以更快的速度进行GO分析和GMT文件解析
- 使用clusterProfiler对非模式植物进行注释
- buildGOmap
- 非模式基因GO富集分析：以玉米为例+使用OrgDb
- enrichGO出不来结果？没结果也是正确的结果
- GO analysis using clusterProfiler
- use simplify to remove redundancy of enriched GO terms
- GO富集分析中的间接注释
- 靠树树会倒，不要太相信你的注释文件！
- ko数据库ID转换
- 听说你的KEGG分析有大量的基因没注释
- 水稻如何做KEGG富集分析
- 使用新姿势玩KEGG，是种什么体验...
- 利用KEGG数据库进行ID转换
- KEGG Module Enrichment Analysis
- 如何利用clusterProfiler获取最新的KEGG和基因对应关系
- KEGG数据本地化，再也不用担心网络问题了
- 多物种批量下载KEGG数据并做成KEGG.db包
- 搞大你的点，让我们画真正的气泡图
- 听说你也在画dotplot，但是我不服！
- dotplot展示富集分析结果
- dotplot for GSEA
- enrichment map
- joyplot：GSEA的结果也能快乐起来
- gseaplot自定义颜色
- DOSE包引用过百
- 还想用clusterProfiler以前的那些画图函数，怎么办？
- 看完此文, 你也能够大开脑洞, 上升逼格
- 画❤️装geek什么的，都弱爆了！
- emojifont新功能（有视频哦）
- phylomoji：用emoji画进化树
- 你所没见过的苹果
- 画图讲故事
- 听说你也有 emojifont 的字体使用困惑
- 点的形状太少？快用emoji来画图！
- enrichplot: 让你们对clusterProfiler系列包无法自拔
- 安装enrichplot及升级clusterProfiler
- dotplot支持使用formula指定x轴变量
- 一样的函数，不一样的upset
- cnetplot只标注部分节点的label
- 多组数据富集分析结果可视化
- 多出来的点是猴子变的吗？
- 所有人都在做富集，但没人在意它的结果
- ggimage：ggplot2中愉快地使用图片
- geom_pokemon: 使用pokemon画图
- 大开眼界+多图慎点：Pokémon x NBA and other fun with ggimage
- 你的专业是那一只Pokémon神兽？
- 纯代码生成banner
- 我的名字和我的姓氏
- 正经的图千篇一律，不正经的叔万里挑一
- 饼图版气泡图
- 转发5个群，Y叔送你一顶帽子
- 用图片当ggplot2画布
- 2018世界杯专属图层
- 每周一图之粉丝来袭～
- ggimage的一波用户图秀
- 看代码学画图 - Nobel化学奖的获得者多半投胎在那些国家？
- 用图片来画图，还带美图效果哦！
- geom_bgimage
- 让我们画个黑板报吧
- shit，拟合的残差这么大！
- ggimage开始画不会变形的图了！
- ggplot2版本的 --> 耗子尾汁
- ggsave支持base plot
- 转UpSet图为ggplot?
- ggplotify简史
- 听说你想把pheatmap和ggplot2拼在一起
- ggplotify - version 0.0.4
- 听说你想把Gviz画的基因结构转成ggplot?
- Ask me anything about ggtree
- 当年ggtree发布文，为整合数据而生！
- ggtree无根树及注释
- 无根树中加入枝长图例
- ggtree画根分支
- phylip树格式
- ggtree版本的plotTree
- align genomic features with phylogenetic tree
- ggjoy facet with ggtree
- reproducible logo generated by ggtree
- 用ggtree重现Figtree的示例进化树
- ggtree for microbiome data
- ggtree for outbreak data
- ggtree支持phylog对象
- ggtree画层次聚类
- 用户数据注释进化树
- 改变outgroup的枝长
- 使用自己的数据来给进化树上色
- bootstrap分段标记
- ggtree中标记树分支？
- xlim_tree: set x axis limits for only Tree panel
- reverse time scale
- vertical dendrogram in ggtree
- 中空的环形树
- 可视化操作树的拓扑结构
- ggtree - updating a tree view
- facet_plot: 加图层到特定的分面上
- facet_plot：加图层到特定分面，方法二
- facet_plot: 关联数据和进化树的通用方法
- facet_plot更改panel label
- 同时让N颗树关联同一个数据集
- 漫画版的进化树你见过吗？
- 取子集画图
- Y叔不想养蛙，只想养你！
- 用图片注释进化树
- 当生物女博士遇到小学二年级语文作业
- identify: 交互式操作进化树
- plotly: 交互式探索进化树
- ggnetworx：让ggtree支持phylogenetic networks
- ggtree买家秀
- ggplot2 - 更改分面的相对宽度
- 听说你想画好几颗树在一起
- 倒不如画一些渐变色的线条吧
- python的世界里没有这么好的工具！
- 风儿啊，它吹乱了我的头发
- ggtree在线书
- 进化树和基因组结构
- ggtree所支持的各种树的布局
- 进化树上随意选几条边来上色
- 进化树上随意选几条边，换线条类型！
- 听说你想在系统发育树上随意加个点？
- 这么多年了，终于有个故事可以讲
- 对ggplot2指定的分面，任性调整xlim和分面宽度！
- 给不同的分面分别设置x label？
- 度量生物多样性
- 进化树与序列的距离矩阵
- 画两颗面对面的树，还要分别加注释！
- 对进化树的分支长度做数据变换
- 一个legend伪装成三个，服气！
- 听说你想给线条画个边框？
- 纯文本的进化树
- 用ggtree画思维导图，小白也能学会！
- 树变图，图变树？
- treeio: 进化树基础类和方法
- 进化树改名
- treeio: Phylogenetic data integration
- Subsetting Phylogenetic Trees
- treeio支持解析MEGA的输出
- Y叔的新玩意--yyplot
- 一次解决ggplot2所有字体
- 映射变量给axis上色
- pubmed年度趋势，你的开题报告需要它！
- ggplot扩展学习笔记--逐行解析Y叔的"geom_ord_ellipse.R"
- 轻松生成专属于你的二维码
- 用par设置ggplot2参数？这个可以有！
- ggplot2版本的维恩图
- 听说你想学R？
- 无中生有windows版R包
- 你所不知道的，R的N种打开方式
- radian: 用python写的，号称21世纪的R终端
- VSCode里愉快地使用R
- 忘掉Rstudio，来用VSCode愉快地进行R远程开发
- R kernel in Jupyter notebook 3
- R的全新IDE
- 遇到这样的坑，那是相当的无助！
- R的诡异事件
- R里的赋值符号？
- 你的数据被化了妆？
- R总给我惊喜
- 听说你R脚本中的数据丢了，图出不来！
- 逼着老狗学新把戏
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- 如何用bioconductor进行注释
- Bioconductor的注释包太旧怎么办？自己做呀
- 听说你画的图，线条不见了
- 欧式距离如何应对缺失值？
- 史前人类怎么使用R
- 《R语言数据可视化之美》 -- 画面太美
- 有个浏览器就可以调戏一下R
- 花式打水印
- 安卓上使用R语言
- R-3.6 -- set.seed
- 呈现数据交给R，修图只会PPT！
- 快上车，该学R了
- windows用户, 截屏新手段
- grid版小蛋糕
- 学习base也很重要
- 你有一封来自data.table作者的邀请信，请查看！
- R画图已入门，怎样进阶？
- 你只有一个系统，却要在多个平台上测试你的R包
- 为了提交R包，我构建了个多版本的R开发环境
- R-4.0.0版本怎么更新
- R包安装之我的地盘我没权限
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- 数值法求一重积分
- 使用蒙特-卡罗方法来估计Pi
- MC积分
- S3面向对象系统
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- 《R语言科学编程及仿真》读书笔记
- 魔镜魔镜告诉我 - 那里的水管最粗大
- 食色性也
- R包辣鸡之CorMut
- 来自R的桌面提醒
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- 听说你用R把证件照给一键换底了
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- mathart：一个富有逼格的R包
- 用R玩一个小游戏吧！拖延症的老毛病又犯了！
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- 画图？倒不如手绘吧！
- 我不会用illustrator，只会用ppt！
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- 听说你还不会画动图
- 爆炸型的饼图
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- 不想画彩图了，用纹理填充吧，省掉好多版面费
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- 跑了R代码，文章不会写，怎么破？
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- flametree学习
- 可别再说base plot不能图形语法！
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- 彩图变轮廓，小朋友再不缺图片涂色了
- 拥有立体字效果的一大波火山图正在向你走来
- 在R中对分子结构进行3D可视化
- crosslink: 分组数据关联关系的网络可视化
- 听说你画图存为PDF多了一页白纸
- Use ggplot2
- ggplot2作图25招：《R入门25个菜谱》中所有图片的ggplot2版本
- 解锁新姿势，万物皆可分面
- 听说你想学ggplot2？我推荐几篇文章给你
- 不需要花时间去学ggplot2主题系统
- 代码无感者的福音，小白也能ggplot2画出高大上的图
- 可交互注释你的ggplot图
- ggplot2字体溢出的那点破事
- 根据GTF画基因的多个转录本结构
- 如何画类似MEME的注释序列
- Q-Q plot
- 邪恶的曲线
- 画一个印象派的蝙蝠吧
- 什么！你的图上有一双看不见的手
- 坑无处不在，以ggplot2的一个坑为例
- ggplot2设置可视化窗口
- ggplot2画图，文本太长了怎么办？
- 画图给点分组?
- 怎样用HOMER算出的P-value画出CNS级别的泡泡图？
- ggplot2 - 3.0.0版本的新功能
- ggplot label placement
- 图层中的统计量，你自己说的算！
- 根号2的几何作图
- 画点之组内再分组
- 论一张ggplot图是怎样炼成的 - 从小白都会画到逼格十足是如何一步步产生的？
- 用散点可视化一个矩阵
- ggplot2给选定的分面加背景
- 同一数据多变量分组的boxplot?
- ggplot2改legend title
- ggplot2小技巧-数据没有，函数倒是有一个
- 我为什么是个ggpubr黑？
- 活人不能让尿憋死，自动出来的图例不好调？自己徒手画一个！
- ggpaired？汤姆猫说no no no
- hadley大神给大家布置作业了，用ggplot2画一张图！
- 画个妹纸，交个作业
- ggupset -- ggplot2版本的upset plot
- 按地理位置分面
- ggplot2分面之像素艺术
- ggridges：一种波涛汹涌，哦不对，是山峰叠峦的可视化方式
- 再见joyplot
- 一条指令把统计+画图都给做了？似乎太美好！
- 用ggplot2画3D
- ggplot2的3维画图时代
- 你画的图有水果的味道，让我咬一口好吗！
- ggtext: ggplot2支持富文本
- ggVennDiagram 诞生记
- ggVennDiagram 的新生
- （翻）云（覆）雨图
- ggstar与ggsymbol的一些原理介绍
- ggsymbol让点图样式更加丰富的R包
- 用ggplot2出GraphPad prism的图
- 听说你还不会画热图
- 多个热图，多种配色，还要分开画图例？
- 连续型和离散型数据一起画热图，外加分开配色和图例
- 不同数据集画出的热图，用同样的颜色区间上色?
- 一个更好用的pheatmap
- 用ggplot2来画带有对角线的热图。
- 看Y叔的R包，写自己的图层。
- 视频教学-小白也能点点鼠标画出对角线热图
- complexHeatmap版本的对角线热图
- 诹图——ggmatrix
- base plot版本的对角线热图
- 检索疫情数据的R包来了
- 各省市的疫情历史数据来了！
- 一次搞定所有的疫情地图
- nCov2019：历史数据实现自动更新
- nCov2019英文版，歪果仁也能用这次武汉疫情的数据了
- 新冠全球历史数据来了
- 「新冠」- 外国的省级历史数据来了
- 当病毒R包nCov-2019遇上动图gganimate
- 爆款风玫瑰图：新冠肺炎全球疫情形势
- 螺旋的疫情图
- 欧洲很方，一不小心都要「意大利」了
- 疫情监测的shinyApp来了！
- 用Dash做一个新冠疫情监测仪表板（dashboard）
- 一个监测各省市新冠状病毒疫情的网站
- 用shiny和echarts4r制作一个COVID-19的dashboard
- 倒不如用R画个新冠病毒吧...
- 印度日增30万？吓得我赶紧画个图来看看！
- Five things biologists should know about statistics
- 什么是T检验
- 富集基因之注释缺失
- 落入窠臼
- 你昨天才做的分析，可能是几年前的结果！
- 掐架的额外收获
- boxplot
- 如何告别单身
- 主成分分析
- 一文解决RT-PCR的统计分析
- 不靠谱的富集软件太多了！
- Bootstrap Method
- 做为朋友，还是要劝说生物狗们不用柱状图！
- 富集分析的p值是怎么算出来的？
- TALEN基因编辑
- 生物实验的基本原理
- 纯文本可视化FASTQ质量数据
- a simple gene finder
- 搭建本地blast
- blast一大坑：无法输出query sequence title
- 简简单单讲insertion size
- pubmed停更？和你没半毛钱关系！你们是想放假想疯了吧？
- 实锤-PubMed没有停更
- 秒杀一切手工画通路的素材
- 我把Nature的Figure画成了蒙娜丽莎
- SIR Model of Epidemics
- 曾老湿最新私已：GATK4实战教程
- 突变的传播
- s01 - Counting DNA Nucleotides
- s02 - Transcribing DNA into RNA
- s03 - Complementing a Strand of DNA
- s04 - Computing GC Content
- s05 - Finding a Motif in DNA
- s06 - Consensus and Profile
- s07 - Finding a Shared Motif
- s08 - RNA Splicing
- s09 - Perfect Matchings and RNA Secondary Structures
- 如何获取文献
- 在这个看脸（哦不对，看图）的时代，做科研的你怎么能错过这个帮你找一张漂亮脸蛋的神器！
- 什么？听说你有文章却不知道该往那里投！
- 听说你也在读文献
- 什么？杂志要求图片要300dpi的TIFF，还限制了文件大小，臣妾做不到啊
- csvtk - 跨平台、高效、实用的CSV/TSV命令行工具
- bioSyntax:针对生物数据的语法高亮
- bioView - 一个生信常用文件格式的可读性增强工具
- 质感满满的简历，你也可以有！
- 每次重投文章，光改格式就花了两周！有了这把刷子，刷两下就好了！
- sci-hub如果挂了，你还有神器下文献吗？
- 再不用担心打不开sci-hub了
- 独家：SciHub苹果桌面版
- 关于scihub，一文就够了
- 一图告诉你sci-hub有多美好！
- Kopernio: 快速一键下文献
- sci-hub合法的可能性
- 一个刷屏的所谓「文献数据库」，都是我十年前玩剩下的！
- 利用scihub自动下载文章的R函数
- 十年前截屏
- 软件更新大法
- scau校园网认证
- realvnc：各种设备互联
- 合体中的操作系统
- 酗酒的Linux不是好企鹅
- 你们想要的: Linux装windows的二逼
- use linux desktop again
- elementaryOS: 2018最美Linux
- ubuntu安装只有redhat版本的454分析软件
- linux版迅雷
- 度娘才是最大的老司机
- 开源的macOS和linux版微信
- 你们想要的：QQ跑在Linux上
- i3wm与wine-QQ不兼容
- 鹅厂终于出Linux版本的QQ了！
- 飞天猫：长着蝙蝠翅膀的猫！
- gotop：一个更有逼格的top
- ydict：命令行在线中英文词典
- 一条相见恨晚的指令
- 手机上愉快地写代码
- vimTermPipe - 在vim中发送代码到终端执行
- 安装Amos
- 用高颜值的指令查看磁盘使用情况
- 终端录屏
- Linux已经30岁了
- 我在MSnbase里做了什么？
- 来香港读博其实是被逼的
- 假期如何假装我们还在工作？
- 博士养成记
- Y叔要求职
- 再见，HKU
- 你好南医大 & 教师节快乐！
- 丹麦压马路
- 黑灯瞎火 - 哥本哈根
- 巴黎压马路
- 那一年，那一场，本属于我的生信处女show，好像从来没有发生过一样！
- 这些年，我上过的课（是上过，不是被上）
- 那些我讲过的oral
- 剑桥膜拜大神记
- 听说我的包用的人还挺多！
- 国庆去哪玩？办公室里写课件！！！
- 2020|南方医科大学基础医学院生物信息学专业招生宣传
- 为了忘却的纪念——我在港大把导师给炒了
- 我招的是博士后啊，不是迷途羔羊！
- YuLab招博后，多组学整合方向
- 听说你的文章也被吐槽英文差？
- 博士版2048，不服来战！
- 滚吧，*年
- 扫盲贴：博士学位知多少
- 给硕博考生的一封信
- 牛逼的博士论文，标题只有两个字符！
- #聚众读博# Y叔招生信方向的硕士、博士、博士后
- 你弱你有理，我还惹不起
- 你还在愁毕业？隔壁实验室的小哥从网上抄了几十行代码打了个R包，发了SCI，毕业了！
- 港校申请指北：考研考博失利之后的另一选择
- 本科生如何加入实验室/老司机的实验室入伙指南
- 站在PhD的大门前
- 你怎么看：生信不就是按按键盘的事么？
- 书读得太少，而想得太多
- 考研党不用学专业课吗？-之一
- 考研党不用学专业课吗？-之二
- 转型：从实验到大数据
- 查找文献中你可能会用到的小脚本
- 你还在愁毕业？隔壁小哥的300行R脚本，发了SCI，毕业了！
- 考研之后呢？别想着去浪，该联系导师，搞毕业设计了
- 我被oncotarget撞了腰的不传奇故事
- 科研人员必备特性：拖！拖！拖！
- 学术朋友圈这一波刷屏的狗粮
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- 听说有SCI文章只要两天就接收？还是洗洗睡吧！
- 请用事实怼我 -,-
- 这是要开后门吗？分区表的意义在哪里？
- 喂，分区表，你的节操掉地上了！
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- 粪便上的头像，悄咪咪地不见了！
- 也谈谈武汉新病毒序列的版权
- 那里有妹纸，那里就有猫
- [连载1]：学术期刊的学术不端，你见过吗？
- [连载2]：Editor你的心不会痛吗？
- [连载3]：辣眼睛，一篇抄袭引发的系列血案！
- [连载4]：我像是一颗棋，进退任由你决定
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- 活久见，抄袭竟是重用他人代码没有致谢？
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