/GenomeBento

Genome bento project with YCAM

YCAM InterLab Camp vol.3

山口情報芸術センター (YCAM) と、ライフサイエンス統合データベースセンター (DBCLS) では、2016年からゲノムが解読された食材だけでつくる「ゲノム弁当」のコラボレーションを続けてきました。これまでの「ゲノム弁当の開発履歴」もご参照ください。

Genome Bento

(画像は https://togotv.dbcls.jp/togopic.2013.18.html より)

2019年3月2日、YCAM InterLab Camp vol.3 では、ゲノム弁当を素材として、その食材に含まれる DNA を MinION シーケンサーで解読し、データベースを使って解読した DNA 配列がどの生物由来のものか検索する実習を行いました。

詳しいレポートが Make: (part 1, part 2) に掲載されているのでぜひご参照ください。

ゲノム弁当解読プロジェクト

参考資料

MinION で読んだ DNA 配列を見てみよう

解析フロー図

今回準備して頂いたゲノム弁当のサンプル

料理(9種類)

  • れんこんひよこ豆味噌煮(れんこん、ひよこ豆、ひよこ豆味噌、のり)
  • 炊き込みごはんの具(大根、にんじん、しめじ、ひえしょうゆ、ごま油)
  • コロッケの中身(さつまいも、ひよこ豆味噌)
  • 漬物 甘酢漬け(白菜、大根、水菜、酢(米)、砂糖(てんさい))
  • きのこスープ
  • ゲノムソース(味噌、アーモンド、しょうゆ、唐辛子、砂糖、ごま)
  • きのこ豆腐ハンバーグ タネ
  • オムレツ(玉子、じゃが芋、玉ねぎ、豆乳、オリーブ油)
  • 人参サラダ(人参、キヌア、オリーブオイル、マスタードシード、くるみ、高菜)

食材(14種類)

  • トマト
  • しめじ
  • 大根
  • かぶ
  • 人参
  • じゃが芋
  • 玉ねぎ
  • レンコン
  • ほうれん草
  • 白菜
  • キャベツ
  • 黒米
  • キヌア
  • ひよこ豆

うち、太字MinION でのシーケンスにつかったもの。

ゲノム弁当の食材を充実させよう

「この食材のゲノムはまだ決まっていないのかな?」と思ったら、 食材の追加方法を見て探してみましょう。

参考文献