Ghost atoms

scripts to handle the lone pairs

Es.

python add_ghost.py file.xyz 1

Cosa c'è

  • Ad ora un piccolo script per aggiungere le coordinate dei lonepair su un atomo di ossigeno da fornire in input
  • la geometria del lonpair è fissa e presa da qui

TODO

  • aggiungere il pezzo per fittare le cariche in modo da mantenere il dipolo il più possibile vicino a quello della totale
  • rimuovere cclib come dipendenza