处理fastq文件获得序列全名

[flystar233]

因为fastq 压缩文件巨大，建索引需要很久，而且占用空间。如果只是简单遍历fastq文件，不做随机读取，就没有必要对fastq建索引。但是不建立索引，使用元祖索引获取序列id时只能获得短名，程序可以不建索引返回序列全名么？

>>>head -1 test.fq
>>>@A00838:157:H2Y5TDSXY:4:1101:1398:1000 1:N:0:ATTCAGAA+CCTATCCT

for read in pyfastx.Fastq('test.fq',build_index=False):
   print(read[0])
>>>A00838:157:H2Y5TDSXY:4:1101:1398:1000

[lmdu]

在最新版本中，已为Fastq添加full_name=True参数，配合build_index=False来获取全名。同时新版本中添加了Fastx类，遍历文件中的reads，返回的元组中comment为，除ID外剩余的名称部分，可以获取全名。

[flystar233]

好的，已经添加full_name=True 解决问题。谢谢~