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Process COVID-19 data for reproducible research

covid19_mexico_data

Aquí se mantienen los datos 🗂️ de fuentes oficiales en formato reproducible para facilitar el análisis del progreso de COVID-19 en México 🦠🇲🇽. Análisis, series de tiempo y gráficas aquí: marianarf/covid19_mexico_analysis.

Fuentes 📈📈📈

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  • Dirección General de Epidemiología - Los archivos en esta carpeta contiene los reportes diarios referente a los casos asociados a COVID-19 publicados por la Dirección General de Epidemiología a partir de 2020-04-12. Los datos se obtienen mediante zip el día de su publicación, o accediendo la base de datos histórica, que contiene los archivos en formato csv.
    • Notas
      • 2020-05-01 - Es importante notar que hay un atraso entre la confirmación de las pruebas.
      • 2020-04-30 - La base de datos ahora incluye la variable ID_REGISTRO, la cual es única y aleatoria para cada caso.
      • 2020-04-21 - A partir de este reporte, puede ser que el campo que reporta más acertadamente dónde se realizó la prueba, es ENTIDAD_RES y no ENTIDAD_UM.

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  • INEGI - Los archivos en esta carpeta contienen los nombres y claves oficiales de las entidades y municipios en México delineadas a través del marco geoestadístico del INEGI.

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  • Secretaría de Salud - Los archivos en esta carpeta contienen csv procesador a partir de las publicaciones diarias sobre COVID-19 que la Secretaría de Salud (InDRE) mantuvo hasta el día 2020-04-19 en formato pdf. Estos archivos fueron convertidos csv usando servicios como ZAMAR y ILovePDF y manualmente tabulando los casos nuevos, que se indican como filas resaltadas en color azul, en los archivos pdf. A partir del día2020-04-19, los reportes de datos oficiales de la SSA han sido descontinuados, y presumiblemente, fueron asimilados por la Dirección General de Epidemiología.
    • Notas
      • 2020-04-10 - Los reportes del día 2020-04-06 y 2020-04-07, en el campo que indica la fecha de inicio de síntomas, contiene la mayor parte de las entradas en formato de número (ejemplo: 43912, 43914 y 43916).
      • 2020-04-09 - A partir de 2020-04-06, los nuevos casos se concatenan al final de los reportes pasado.
      • 2020-04-01: Cambia de forma significativa la estructura de sus datos y también elimina el campo Origen.

Más información 🔍

Si eres reserarcher 👩‍🔬👨‍🔬📈 y quieres incepcionar a las meras, meras, fuentes, hay otros repos y sitios no oficiales que se han dedicado a mantener, comentar y archivar los datos y las series de tiempo de fuentes oficiales: