https://colab.research.google.com/drive/1HIAOEMfJkgf1sxexXTzTosAYzi-DwjZ-?usp=sharing
| Гистоновая метка | Имя файла |
|---|---|
| H2az | K562_H2az.bam |
| H3k27ac | K562_H3k27ac.bam |
| H3k27me3 | K562_H3k27me3.bam |
| H3k36me3 | K562_H3k36me3.bam |
| H3k4me1 | K562_H3k4me1.bam |
| H3k4me2 | K562_H3k4me2.bam |
| H3k4me3 | K562_H3k4me3.bam |
| H3k79me2 | K562_H3k79me2.bam |
| H3k9ac | K562_H3k9ac.bam |
| H3k9me1 | K562_H3k9me1.bam |
| Номер эпигенетического типа | Присвоенное название | Характерная метка | Другие свойства |
|---|---|---|---|
| 1 | Transcribed | H3K36me3, H3K27ac | Попадает на гены. Слабый сигнал |
| 2 | Heterochromatin | - | Самый частовстречающийся тип в геноме. Нет четкой корреляции с определенной меткой |
| 3 | Transcriptional | H3K36m3 | Попадает на ген, сильный сигнал |
| 4 | Transcriptional | H3K79m2 | Сильный сигнал |
| 5 | Promoter | H3K27ac, H3K4m* | Сильный сигнал |
| 6 | Repressed | - | Слабый сигнал |
| 7 | Enchancer | H3K4m*, H2AFZ | Сильный сигнал |
| 8 | Enchancer | H2AFZ | Может как попадать, так и не попадать на ген. Сигнал сильный |
| 9 | Promoter | H3K4m* | В начале генов. Сигнал средний |
| 10 | Enchancer | Почти все | Сильный сигнал |
