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Openbiox 翻译小组发起并维护的优秀 Workflow 翻译项目

Awesome-Bioinformatics-Workflow-Chinese

Openbiox 翻译小组 发起并维护的优秀 Workflow 翻译项目

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第一期：Bioconductor workflow

Bioconductor 是生物信息分析过程中绕不过的工具，同时也是我们入们和进阶生物信息极好的学习材料。因此我们将 Bioconductor workflow 的翻译作为 Awesome-Bioinformatics-Workflow-Chinese 的第一期开放项目，并在今后持续更新。

Bioconductor workflow 官方网址：https://bioconductor.org/packages/3.9/workflows/ (本次翻译针对 Bioconductor 3.9 版本)

根据下载次数，文档质量更新时间和涉及领域等，本次开放 10 个作为第一批认领内容。分别是：

  1. rnaseqGene：RNA-seq workflow: gene-level exploratory analysis and differential expression (R package version 1.8.0)
  2. simpleSingleCell：A step-by-step workflow for low-level analysis of single-cell RNA-seq data with Bioconductor (R package version 1.8.0)
  3. TCGAWorkflow：TCGA Workflow Analyze cancer genomics and epigenomics data using Bioconductor packages (R package version 1.8.0)
  4. systemPipeR: NGS workflow and report generation environment (R package version 1.18.0)
  5. annotation：Genomic Annotation Resources (R package version 1.8.0)
  6. methylationArrayAnalysis： A cross-package Bioconductor workflow for analysing methylation array data (R package version 1.8.1)
  7. rnaseqDTU：RNA-seq workflow for differential transcript usage following Salmon quantification (R package version 1.4.0)
  8. chipseqDB：A Bioconductor Workflow to Detect Differential Binding in ChIP-seq Data (R package version 1.8.0)
  9. maEndToEnd：An end to end workflow for differential gene expression using Affymetrix microarrays (R package version 2.4.0)
  10. RnaSeqGeneEdgeRQL：Gene-level RNA-seq differential expression and pathway analysis using Rsubread and the edgeR quasi-likelihood pipeline (R package version 1.8.0)

项目成员

发起人：@郑东旭

负责人： @赵飞

参与人：@闫超 @陈晓宇 @胡海飞 @李欣 @李新强 @刘潜 @彭丹丹 @王潇 @吴亮 @谢程舒 @叶璇 @郑东旭 @赵飞

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