microdatasus

O pacote para o R microdatasus apresenta funções para download dos arquivos de microdados do DataSUS (formato DBC), leitura dos arquivos através do pacote read.dbc e pré-processamento para utilização. Nesta última etapa, os rótulos e formato das variáveis são atribuídos e tratados.

Instalação

install.packages("remotes")
remotes::install_github("rfsaldanha/microdatasus")

Utilização

A utilizaço do pacote consiste, em geral, no uso de duas funções: uma realiza o download dos dados e outra o pré-processamento dos mesmos.

Exemplo

library(microdatasus)
dados <- fetch_datasus(year_start = 2013, year_end = 2014, uf = "RJ", information_system = "SIM-DO")
dados <- process_sim(dados)

O manual para a utilização do pacote encontra-se na Wiki do projeto.

Sistemas de Informação em Saúde suportados

Download: SIM, SINASC, SIH, CNES, SIA, SINAN-DENGUE, SINAN-CHIKUNGUNYA, SINAN-ZIKA, SINAN-MALARIA.
Pré-processamento: SIM, SINASC, SIH-RD, CNES-ST, CNES-PF, SINAN-DENGUE, SINAN-CHIKUNGUNYA, SINAN-ZIKA, SINAN-MALARIA.

Agradecimento

O desenvolvimento deste pacote não seria possível sem a função read.dbc criada por Daniela Petruzalek, através do pacote read.dbc.

Como citar

Peço aos usuários que citem o pacote sempre que ele for utilizado.

SALDANHA, Raphael de Freitas; BASTOS, Ronaldo Rocha; BARCELLOS, Christovam. Microdatasus: pacote para download e pré-processamento de microdados do Departamento de Informática do SUS (DATASUS). Cad. Saúde Pública, Rio de Janeiro , v. 35, n. 9, e00032419, 2019 . Available from http://ref.scielo.org/dhcq3y.

Dúvidas e sugestões

Crie uma issue no projeto ou envie um e-mail para raphael.saldanha@icict.fiocruz.br

rafapereirabr/microdatasus