Versión de python: Python 3.7.6
El dataset ubicado en el directorio data/raw/test y data/raw/train fue obtenido de diversos links mencionados en https://github.com/lindawangg/COVID-Net. La unificación de dicho dataset se realizó con la notebook encontrada en notebooks/create_dataset.ipynb obtenida del proyecto COVIDx y modificada.
data: Directorio que contiene las imágenes en su estadoraw, procesado intermedio y resultantenotebooks: dentro se encuentra los scripts y código en python base del trabajo práctico finalresults: contiene imágenes y reportes a utilizar en la versión escrita del trabajo práctico.
create_dataset.ipynb- Script utilizado para unificar múltiples datasets de radiografías frontales y laterales de tórax con su correspondiente diagnóstico. Obtiene como resultado 2 carpetas (test y train) con las imágenes y 2 archivos csv (test y train) con su metadata.
preprocessing.ipynb- Script utilizado para el preprocesamiento de imágenes para la utilización de HOG y NMF
hog.ipynb- Script utilizado para entrenamiento y prueba del modelo de HOG.
Se debe instalar jupyter notebook y correrlo desde la raíz del repositorio. Desde la interfaz de jupyter se pueden correr cada uno de los scripts