感染がどのように起こっているか、COVID-19「愛知県内の感染者・遺伝子検査件数」の情報を用いて感染者間の関係をグラフにしてみました。
https://github.com/nkawa/covid19-aichi-infection/blob/master/covid19_aichi20200505.pdf
なお、この図には371名の接触履歴が判明感染者が掲載されています。(残りの120名近くは不明) 図を見る限り、3~4つの大きな感染集団があることがわかります。
コードも公開予定ですが、整理できていないので、とりあえずできているデータだけでも公開します。 (泥臭いデータクレンジングなどがいろいろあります)
- コード整理(公開に向けて)
- 外部からの感染情報(海外など)の追加
- 感染者重みの計算
「愛知県内の感染者・遺伝子検査件数」 (なお、一部の接触者で「又は」という表現がありますが、両方からのリンクを生成しています) また、変換中のバグ等により、誤ったリンクが張られている可能性もあります。適宜更新予定。
https://www.pref.aichi.jp/site/covid19-aichi/kansensya-kensa.html
なお、愛知県のPDFは、 Code for Nagoya の有志によって、csvデータ化されており、このデータを元にしています。
https://github.com/code4nagoya/covid19/blob/development/data/patients.csv
この件、興味ある方は河口の twitter @nkawa ( https://twitter.com/nkawa ) もしくは、Facebook ( https://fb.me/nobuo.kawaguchi )などにご連絡ください。
もっとカッコよくしてくれるのも大歓迎です。