/pytorch_bert_bilstm_crf_ner

基于pytorch的bert_bilstm_crf中文命名实体识别

Primary LanguagePython

pytorch_bert_bilstm_crf_ner

补充CLUE实例

具体流程和医疗的类似,原始数据可以从这里下载:https://github.com/GuocaiL/nlp_corpus/tree/main/open_ner_data/cluener_public

!python main.py \
--bert_dir="../model_hub/chinese-bert-wwm-ext/" \
--data_dir="./data/CLUE/" \
--log_dir="./logs/" \
--output_dir="./checkpoints/" \
--num_tags=41 \
--seed=123 \
--gpu_ids="0" \
--max_seq_len=150 \
--lr=3e-5 \
--crf_lr=3e-2 \
--other_lr=3e-4 \
--train_batch_size=32 \
--train_epochs=3 \
--eval_batch_size=32 \
--max_grad_norm=1 \
--warmup_proportion=0.1 \
--adam_epsilon=1e-8 \
--weight_decay=0.01 \
--lstm_hidden=128 \
--num_layers=1 \
--use_lstm='False' \
--use_crf='True' \
--dropout_prob=0.3 \
--dropout=0.3 \

precision:0.7802 recall:0.8176 micro_f1:0.7984
              precision    recall  f1-score   support

    position       0.77      0.82      0.80       425
       movie       0.88      0.77      0.82       150
        name       0.84      0.90      0.87       451
        book       0.86      0.81      0.83       152
     address       0.65      0.68      0.66       364
organization       0.81      0.81      0.81       344
       scene       0.73      0.76      0.74       199
  government       0.77      0.87      0.82       244
        game       0.76      0.90      0.82       287
     company       0.80      0.81      0.81       366

    micro-f1       0.78      0.82      0.80      2982

彭小军认为国内银行现在走的是**的发卡模式先通过跑马圈地再在圈的地里面选择客户Load ckpt from ./checkpoints/bert_crf/model.pt
Use single gpu in: ['0']
{'name': [('彭小军', 0)], 'address': [('**', 15)]}

补充医疗实例

1、在data/CHIP2020/raw_data下是原始数据,使用process.py处理raw_data以获取mid_data下的数据。原始数据可以去这里下载:https://github.com/zhangzhiyi0108/CHIP2020_Entity
2、修改preprocess.py里面为自己定义的数据集,并指定数据地址及最大长度,稍后的自定义参数需要保持和这里的一致。
3、修改main.py里面为自己定义的数据集及相关参数。
4、修改main.sh里面运行指令的相关参数,最后运行即可。
5、基于bert_crf训练好的模型可以去这里下载:链接:https://pan.baidu.com/s/1if6G00ERfXSWfe_h23hgDg?pwd=2s3e 提取码:2s3e

!python main.py \
--bert_dir="../model_hub/chinese-bert-wwm-ext/" \
--data_dir="./data/CHIP2020/" \
--log_dir="./logs/" \
--output_dir="./checkpoints/" \
--num_tags=37 \
--seed=123 \
--gpu_ids="0" \
--max_seq_len=150 \
--lr=3e-5 \
--crf_lr=3e-2 \
--other_lr=3e-4 \
--train_batch_size=32 \
--train_epochs=3 \
--eval_batch_size=32 \
--max_grad_norm=1 \
--warmup_proportion=0.1 \
--adam_epsilon=1e-8 \
--weight_decay=0.01 \
--lstm_hidden=128 \
--num_layers=1 \
--use_lstm='False' \
--use_crf='True' \
--dropout_prob=0.3 \
--dropout=0.3 \

Load ckpt from ./checkpoints/bert_crf/model.pt
Use single gpu in: ['0']
precision:0.6477 recall:0.6530 micro_f1:0.6503
          precision    recall  f1-score   support

     equ       0.57      0.57      0.57       238
     sym       0.59      0.45      0.51      4130
     pro       0.60      0.68      0.64      2057
     bod       0.63      0.66      0.64      5883
     dis       0.71      0.78      0.74      4935
     dru       0.77      0.86      0.81      1440
     mic       0.73      0.82      0.77       584
     dep       0.59      0.53      0.56       110
     ite       0.47      0.40      0.43       923

micro-f1       0.65      0.65      0.65     20300

大动脉转换手术要求左心室流出道大小及肺动脉瓣的功能正常但动力性左心室流出道梗阻并非大动脉转换术的禁忌证Load ckpt from ./checkpoints/bert_crf/model.pt
Use single gpu in: ['0']
{'pro': [('大动脉转换手术', 0), ('大动脉转换术', 42)], 'bod': [('左心室流出道', 9), ('肺动脉瓣', 18)], 'dis': [('动力性左心室流出道梗阻', 29)]}

最初说明

基于pytorch的bert_bilstm_crf中文命名实体识别
要预先下载好预训练的bert模型,放在和该项目同级下的model_hub文件夹下,即:
model_hub/bert-base-chinese/
相关下载地址:bert-base-chinese
需要的是vocab.txt、config.json、pytorch_model.bin
你也可以使用我已经训练好的模型,将其放在checkpoints下:
链接:https://pan.baidu.com/s/1yIGnQ9I_4HAfQSqHod-hMQ
提取码:4j47
里面有四种模型对应的model.pt

目录结构

--checkpoints:模型保存的位置
--data:数据位置
--|--cner:数据集名称
--|--|--raw_data:原始数据存储位置,里面有个process.py用于转换文本+标签json
--|--|--mid_data:保存处理之后的json文件,标签等;
--|--|--final_data:存储处理好之后可用的pickle文件
--logs:日志存储位置
--utils:辅助函数存储位置,包含了解码、评价指标、设置随机种子、设置日志等
--config.py:配置文件
--dataset.py:数据转换为pytorch的DataSet
--main.py:主运行程序
--main.sh:运行命令
--bert_base_model.py:Bert模型
--bert_ner_modelpy:利用Bert进行Ner的模型
--preprocess.py:预处理,主要是处理数据然后转换成DataSet

依赖

python==3.6
pytorch==1.6.0
pytorch-crf==0.7.2

运行命令

python main.py \
--bert_dir="../model_hub/bert-base-chinese/" \
--data_dir="./data/cner/" \
--log_dir="./logs/" \
--output_dir="./checkpoints/" \
--num_tags=33 \
--seed=123 \
--gpu_ids="0" \
--max_seq_len=150 \
--lr=3e-5 \
--crf_lr=3e-2 \
--other_lr=3e-4 \
--train_batch_size=32 \
--train_epochs=3 \
--eval_batch_size=32 \
--max_grad_norm=1 \
--warmup_proportion=0.1 \
--adam_epsilon=1e-8 \
--weight_decay=0.01 \
--lstm_hidden=128 \
--num_layers=1 \
--use_lstm='True' \
--use_crf='False' \
--dropout_prob=0.3 \
--dropout=0.3 \

我们可以通过控制--use_lstm和--use_crf来切换使用bilstm或crf。

结果

训练、验证、测试和预测

由于忘记保存其它测试和预测了,这里就只展示bert的。

2021-08-05 16:19:12,787 - INFO - main.py - train - 52 -trainepoch:2 359/360 loss:0.0398
2021-08-05 16:19:14,717 - INFO - main.py - train - 56 - [eval] loss:1.8444 precision=0.9484 recall=0.8732 f1_score=0.9093
2021-08-05 16:32:20,751 - INFO - main.py - test - 130 -           
             precision    recall  f1-score   support

     PRO       0.86      0.63      0.73        19
     ORG       0.94      0.91      0.92       543
    CONT       1.00      1.00      1.00        33
    RACE       1.00      0.93      0.97        15
    NAME       0.99      0.93      0.96       110
     EDU       0.98      0.94      0.96       109
     LOC       0.00      0.00      0.00         2
   TITLE       0.95      0.84      0.89       770

micro-f1       0.95      0.88      0.91      1601

2021-08-05 16:32:20,752 - INFO - main.py - <module> - 218 - 虞兔良先生1963年12月出生汉族**国籍无境外永久居留权浙江绍兴人**党员MBA经济师2021-08-05 16:32:22,892 - INFO - trainUtils.py - load_model_and_parallel - 96 - Load ckpt from ./checkpoints/bert/model.pt
2021-08-05 16:32:23,205 - INFO - trainUtils.py - load_model_and_parallel - 106 - Use single gpu in: ['0']
2021-08-05 16:32:23,239 - INFO - main.py - predict - 156 - {'NAME': [('虞兔良', 0)], 'RACE': [('汉族', 17)], 'CONT': [('**国籍', 20)], 'TITLE': [('**党员', 40), ('经济师', 49)], 'EDU': [('MBA', 45)]}

验证集上对比

models loss precision recall f1_score
bert 1.8444 0.9484 0.8732 0.9093
bert_bilstm 2.0856 0.9540 0.8670 0.9084
bert_crf 26.9665 0.9385 0.8957 0.9166
bert_bilstm_crf 30.8463 0.9382 0.8919 0.9145

以上训练的都是3个epoch。

补充

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