Sageでもjupyterのnotebookがスタンダードになり、Sageだけでなく、 Pandasやtheano等のpythonパッケージを使ったnotebookが増えてくると思います。
Vagrantを使って仮想マシンに構築したSageの紹介とこれまで作成したnotebookをjupyterに移植し、 紹介して行きます。また、必要なパッケージのインストール方法についても適宜説明します。
今回使用するVagrantの仮想マシン（Vagrantではboxと呼びます）の作成方法については、 以下のリンクで紹介しています。
環境構築に必要なアプリケーションは、以下の２つです。
VirtualBoxは、以下のダウンロードサイトからお使いの環境に合わせてダウンロードし、インストールしてください。
Vagrant（ベイグラント）は、以下のダウンロードサイトからお使いの環境に合わせてダウンロードし、インストールしてください。
準備ができましたので、SageMathをVirtualBoxの仮想マシンで動くようにします。
Githubの以下のURLからjupyter用のnotebookとvagrant環境構築用ファイルをダウンロードします。
ターミナルソフトを起動し、以下のGitコマンドを使って必要なファイルをダウンロードします。
$ git clone https://github.com/take-pwave/jupyter.gitGitでcloneを作った場合、ブランチを作成しておくと追加されたnotebookの取り込みが楽になります。
$ cd jupyter
$ git branch develop
$ git checkout developgitコマンドが使えない場合には、以下のURLの「Clone or download」をクリックし、Download ZIPを選択してください。
Vagrantには、自分の作成した仮想マシンをからboxファイルを作成するpackage機能が提供されています。 Ubuntu14.04にSageMathをインストールして、以下のパッケージを追加したboxを私の公開しているSage サーバ（www15191ue.sakura.ne.jp）にアップしました。
私の公開しているSageMath環境には、以下のパッケージをインストールしています。
- pythonパッケージ -- pandas 0.18.1
jupyterをダウンロードしたディレクトリをDOWNLOAD_DIRとします。 ターミナルソフトを起動して、以下のコマンドを入力してください（$ の後のコマンドを入力）。
$ cd DOWNLOAD_DIR/MySageMath
$ vagrant upSageサーバからboxファイルがダウンロードされ、仮想マシンが起動します。
boxをダウンロードしている途中にtime outでエラーになった場合には、再度vagrant upを実行すると 以前ダウンロードしたファイルに追加して処理します。
3.81GBのファイルをダウンロードするため、完了するまでかなり時間が掛かります。
ダウンロードが終わり、仮想マシンが起動すると以下の様な画面が表示されます。
==> default: Clearing any previously set network interfaces...
==> default: Preparing network interfaces based on configuration...
default: Adapter 1: nat
==> default: Forwarding ports...
default: 8888 (guest) => 8888 (host) (adapter 1)
default: 22 (guest) => 2222 (host) (adapter 1)
==> default: Running 'pre-boot' VM customizations...
==> default: Booting VM...
==> default: Waiting for machine to boot. This may take a few minutes...
default: SSH address: 127.0.0.1:2222
default: SSH username: vagrant
default: SSH auth method: private key
default: Warning: Remote connection disconnect. Retrying...
==> default: Machine booted and ready!
==> default: Checking for guest additions in VM...
==> default: Mounting shared folders...
default: /vagrant => /Users/take/proj/jupyter/MySageMath
==> default: Machine already provisioned. Run `vagrant provision` or use the `--provision`
==> default: flag to force provisioning. Provisioners marked to run always will still run.
仮想マシンを終了するには、以下のコマンドを入力してください（$ の後のコマンドを入力）。
$ vagrant haltブラウザーで以下のURLを開きます。
http://localhost:8888/
jupyterの初期画面が表示されます。
新しくノートブックを作成する場合には、ここで表示されているnotebookディレクトリ中で作成してください。
ブラウザーに表示された「notebook」をクリックし、その中の「GettingStart.ipynb」をクリックしてください。
以下の様に「GettingStart」ノートブックの内容が表示されます。
File, Edit等のメニューが並んでいる右端には、現在実行しているカーネル（ここではSageMath 7.2）の種類が表示されます。 もしも現在稼働中のカーネルが異なっている場合には、「Kernel」→「Change kernel」メニューから「SageMath 7.2」を選択してください。
jupyterのnotebook内に作成されたファイルは、vagrantのファイル共有機能を使って仮想マシンを実行しているマシン（ホストマシン）のDOWNLOAD_DIR/MySageMath/notebookに保存されます。
作成したノートブックのバックアップやファイルの追加・削除もホストマシンで簡単にできます。
これまで作成したSageのノートブックをjupyterに移植するため、Githubの内容は日々更新されます。
gitコマンドを使って安全にGithubの更新情報を取り込む方法を説明します。
最初に作業中のブランチがdevelopであることを確認します。 developに*が付いており、作業中のブランチがdevelopであることを確認できました。
$ git branch
* develop
master次に、現在の作業をコミットします。ここではコミットのコメントを'temp snap'としました。
$ git add .
$ git commit -m 'temp snap'ブランチをmasterに変更し、Githubの更新を取り込みます。
$ git checkout master
$ git pull再度、ブランチをdevelopに切換、masterへの変更をdevelopに取り込みます。
$ git checkout develop
$ git rebase master複数のマシンでSageMathを使いたい場合、毎回boxファイルのダウンロードに時間が掛かってしまい大変です。
自分の環境のMySageMath仮想マシンからboxファイルを作成し、他のマシンで使用する方法を紹介します。
以下のコマンドで現在使用しているMySageMath仮想マシンのboxファイルを作成します。
$ cd DOWNLOAD_DIR/MySageMath
$ vagrant package
==> default: Clearing any previously set forwarded ports...
==> default: Exporting VM...
==> default: Compressing package to: /Users/take/proj/jupyter/MySageMath/package.box
これで、package.boxファイル（3.81GB）が出来上がります。 USBメモリ等でpackage.boxを他のマシンにコピーし、以下のコマンドを使って取り込みます。 作業が完了すれば、package.boxは不要なので削除します。
$ vagrant box add MySageMath package.box
$ rm package.boxMySageMathのboxにインストールされている（あるいはしたい）パッケージは、 以下のページを参照してください。