vonHousen/lime

Lime: Explaining the predictions of any machine learning classifier

lime

Skopiowana wersja oryginalnego repozytorium LIME. Zawiera autorskie modyfikacje oraz przeprowadzone badania efektywności w ramach wykonanej pracy magisterskiej.

This is the forked version of original LIME repository. Contains modified version of the library and efficiciency study done during preparing thesis.

Najważniejsze zmienione elementy biblioteki

• doc/mod/ - katalog zawierający środowisko testowe, czyli wszystkie zmiany związane z prowadzeniem badań efektywności

  • doc/mod/data/ - katalog przechowujący zbiory danych w oryginalnej formie, wykorzystane w środowisku testowym

    • doc/mod/data/img/ - katalog zawierający obrazki przedstawiające wygenerowane wyjaśnienia

  • doc/mod/saved_results/ - katalog przechowujący surowe wyniki przeprowadzonych eksperymentów (pliki o przyrostku *_v4.npy)

  • doc/mod/notebooks/ - katalog przechowujący notatniki jupyter notebook wykorzystane w prowadzonych badaniach:

    • doc/mod/notebooks/EfficiencyTest_* - pliki o tym przedrostku to notatniki, które opisują przeprowadzone badania efektywności
    • doc/mod/notebooks/DatasetLookup.ipynb - notatnik służący przeglądaniu zbiorów danych składających się na środowisko testowe
    • doc/mod/notebooks/fidelity_comparison.ipynb - notatnik w którym porównano uzyskane wyniki wierności odwzorowania
    • doc/mod/notebooks/NormalizationMethods.ipynb - notatnik prezentujący zaprojektowaną metodę normalizacji
    • doc/mod/notebooks/test_*.ipynb - pliki o tym przedrostku to notatniki zawierające proste testy użycia zaimplementowanych modyfikacji
    • doc/mod/notebooks/tree_explanation_multiregressor.ipynb - plik generujący zaimplementowane nowe formy wyjaśnienia w postaci grafu reguł (obrazki) oraz tekstowej

  • doc/mod/utils/ - katalog do przechowywania pomocniczych modułów wykorzystywanych w środowisku testowym

• lime/ - pakiet stanowiący serce biblioteki, przechowujący moduły służące do generowania wyjaśnień

  • lime/explanation.py, lime/explanation_mod.py - klasy reprezentujące wyjaśnienie predykcji
  • lime/lime_base.py, lime/lime_base_mod.py - klasy bazowe, odpowiadające za trening modelu zastępującego
  • lime/lime_base_multiclassifier.py, lime/lime_base_multiregressor.py, lime/lime_base_singleclassifier.py - klasy podrzędne, realizujące trening modeli zastępujących zgodnie z zaprojektowanymi modyfikacjami
  • lime/tabular.py, lime_tabular_mod.py - klasy bazowe, których instancje przygotowują argumenty do wyjaśnienia predykcjia na danych tabelarycznych
  • lime/lime_tabular_multiclassifier.py, lime/lime_tabular_multiregressor.py, lime/lime_tabular_singleclassifier.py - klasy podrzędne, generujące wyjaśnienia predykcji na danych tabelarycznych

Przygotowanie środowiska

W celu poprawnego uruchomienia, wskazane jest utworzenie wirtualnego środowiska virtualenv z Python 3.7:

virtualenv -p <ścieżka prowadząca do Python 3.7> <nazwa środowiska>

Po utworzeniu wirtualnego środowiska należy je uruchomić:

source <nazwa środowiska>/bin/activate

Aby zapewnić wszystkie niezbędne pakiety, można je automatycznie zainstalować zgodnie z plikiem requirements.txt:

pip install -r requirements.txt