washingtoncandeia/fgsea

Análises de enriquecimento funcional de genes utilizando Gene Set Enrichment Analysis (GSEA). Este algorítmo utiliza conjuntos de genes anotados a priori, os quais foram agrupados por estarem envolvidos na mesma via biológica, para obtenção de enriquecimento funcional dos genes obtidos por análises de RNA-seq.

Análise de Enriquecimento Funcional de Genes

GSEA MSigDB e fgsea (R, Bioconductor)

Análises utilizando workflow kallisto -> tximport -> DESeq2 -> GSEA (fgsea)

Análises de enriquecimento funcional de genes utilizando Gene Set Enrichment Analysis (GSEA).
Este algorítmo utiliza conjuntos de genes anotados a priori, os quais foram agrupados por estarem envolvidos na mesma via biológica, para obtenção de enriquecimento funcional dos genes obtidos por análises de RNA-seq.