- 给出一段未知功能的基因片段，获得该基因片段的功能，主要是通过计算机模拟的方法。
- 流程
- 获取基因序列
- 获取待检测基因片段
- DNA -> RNA -> 蛋白质
- DNA -> RNA -> 氨基酸序列：这个过程已经实现 Expasy
- 氨基酸序列 -> 蛋白质结构：SWISS-MODEL + VMD(可视化)
- 氨基酸层次：DeepView
- 分析蛋白质结构及功能
- chemdraw 蛋白质结构转 pdb
- gaussview 画分子
- 推断基因片段功能
- 实现方式
- 计算模拟
- Python C C++
- 可视化
- 实验
- 找一个已经确定功能的基因片段进行转录
- 基因数据
- config/config.txt 配置文件
- pyfunc Python函数
- kownledge 知识数据
- python3.5(pandas, numpy, matplotlib)
- gromacs(模拟)
- 20180627 DNA 到氨基酸序列的实现，并验证结果
- 20180629 氨基酸序列到蛋白质结构的实现方法
- 20180701 CesA protein CesA 基因族控制纤维素合成酶的合成
- 20180706 纤维素合成酶的gromacs 计算模拟结束，用时3天
- 20180707（勿忘国耻） 生成回旋半径随时间变化图
