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General summary of COVID-19 positive cases, deaths and vaccine doses administered nationwide in Peru.

Primary LanguageJupyter Notebook

COVID-19 en Perú

El objetivo del repositorio es integrar información, generar tablas resumen y visualizar datos referentes a COVID-19 de todo el Perú. Así facilitar el uso de los mismos para reportes y boletines de salud, investigaciones epidemiológicas, y apoyar en el proceso de toma de decisiones por parte de instituciones gubernamentales encargadas del área de salud.

IMPORTANTE: Repositorio fuera de mantenimiento.

Tabla de Contenidos

1. Data Products (Data)

Data products, datos finales o tablas resumen obtenidos se encuentran en el directorio Data. Todos los archivos se encuentran en formato de valores separados por comas (CSV).

NOTA: Algunos dataset resultantes no se encuentran en el repositorio debido a su excesivo tamaño, en su lugar visitar el Google Drive con todos los Data Products.

  • Data Product 1: Dataset de casos positivos, fallecidos y personas completamente vacunadas contra COVID-19 respecto a grupos etáreos y departamentos por cada semana epidemiológica y año.

  • Data Product 2: Dataset resumen de casos positivos, fallecidos y número de dosis administradas por cada departamento del Perú. De la misma manera se agrega el número de habitantes de cada departamento, para calcular la tasa de mortalidad por 100 000 habitantes y el porcentaje de vacunación respectivo.

  • Data Product 3: Dataset de TODOS los casos positivos por COVID-19 reportados en Perú, más información de fallecimiento y vacunación de los mismos.

  • Data Product 4: Dataset con el número de casos positivos y fallecimientos por COVID-19 reportados diariamente.

  • Data Product 5: Dataset de todos los casos positivos para COVID-19 con información codificada (para un mejor manejo).

  • Data Product 6: Dataset de TODOS los fallecidos por COVID-19 más información sobre vacunación de los mismos. Dosis 1,2 o 3 aplicadas, tipo de vacuna y fecha de vacunación de cada una.

Gráficas de análisis de resultados disponibles en Images.

Ejemplo: Total de muertes por COVID-19 en Perú desde que comenzó la campaña de vacunación (SE6-2021) vs porcentaje de la población completamente vacunada.

Esta es una imagen de ejemplo

2. Fuentes de datos (RawData)

En el directorio de se encuentran todas las bases de datos que fueron usados para generar tablas resumen y gráficas. Las fuentes de datos se encuentran "crudas", tal y como se obtuvieron a través de la Plataforma Nacional de Datos Abiertos del Gobierno del Perú.

  1. Fallecidos por COVID-19
  2. Vacunación contra la COVID-19
  3. Casos positivos por COVID-19
  4. Centros de vacunación
  5. Códigos equivalentes de UBIGEO del Perú

Toda la información usada en este repositorio fue obtenida mediante fuentes oficiales como el Instituto Nacional de Estadística e Informática (INEI) o el Ministerio de Salud del Perú (MINSA).

3. ¿Cómo funciona?

Proximamente...

4. Fuentes de información

5. Contacto

Todos los scripts, gráficos, procesos de limpieza y manejo de bases de datos epidemiológicos fueron realizados por Otto Proaño (@xxotto) durante el transcurso de pasantías de investigación (07/2021 - 12/2021) dentro del Laboratorio de Investigación en Enfermedades Emergentes - EmergeLab, de la Universidad Peruana Cayetano Heredia (UPCH) bajo la supervisión de David W. Chaupis-Meza. Cualquier duda, comentario o sugerencia será bienvenida.

Correo de contacto: otto.proano@hotmail.com

6. Agradecimientos

Proyecto inspirado en el repositorio Datos-COVID19 de MinCiencia.