TianChi_Protein-Secondary-Structure-Prediction

比赛题目

文件说明

  • model.py:定义并生成模型
  • evaluate.py:加载训练得到的参数并进行二级结构预测
  • preprocess.py:预处理数据
  • dataset.py:划分数据集
  • whole_sequence-best.hdf5.xz:已经训练好的网络参数,线上成绩0.772
  • train.py:训练模型

方案介绍

特征表示

网络结构

结果复现

  1. 下载model.py、evaluate.py、dataset.py,下载whole_sequence-best.hdf5.xz并解压,放在同一个文件夹下。
  2. 将evaluate.py中的filepath改成测试数据的路径,然后执行python evaluate.py。