yunmika/lab-server

Server usage instructions

实验室服务器使用手册

一、 远程登录

服务器ip地址：
推荐使用 MobarXterm 进行远程访问服务器。

二、用户管理

1. 普通用户初始密码为123456，请创建用户后自行修改密码，防止数据丢失。
2. 为了数据安全,普通用户不给管理员权限，如有特殊情况由管理进行配置。

三、软件安装与配置

1. 使用软件前查看管理员是有已经安装。
2. 管理员提前自动安装常用软件（seqtk、seqkit、blast、samtools等）。
3. 管理员手动安装的软件在 /pub/software 目录下。
4. 对应管理未下载的软件普通用户可以在自己的家目录下载miniconda进行软件下载或者创建新的环境变量使用anaconda下载。

四、服务器使用注意事项

1. 高峰期普通用户线程数使用最好不超过 50，内存不超过500G
2. 服务器避免大量数据传输，对于大量数据传输可以使用移动硬盘在实验室进行传输，如果不会操作可以找管理员。

五、磁盘管理

为防止软件运行产生大量中间文件使服务器磁盘爆满，普通用户存储空间为20T，如果空间不足可以联系管理员（最好时常清理垃圾文件）。

六、容器使用（singularity）

对与一些对环境依赖比较复杂的软件，使用singularity进行封装成容器。管理员会逐步把封装的容器存放在/pub/containers中，管理员已经配置好go语言的环境，便于普通用户封装和使用容器。